Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 39

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	12121145	T-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g21630
SBS	Chr1	19337664	T-C	HET
SBS	Chr1	31682852	C-A	HET
SBS	Chr2	7392792	C-T	HET
SBS	Chr2	18883534	G-A	HET
SBS	Chr2	25430035	A-G	HET
SBS	Chr2	27211470	T-A	HET
SBS	Chr2	27211471	A-T	HET
SBS	Chr2	29061892	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g47560
SBS	Chr2	32959529	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g53810
SBS	Chr3	3059637	C-T	HET
SBS	Chr3	3911601	A-T	HET
SBS	Chr3	25577455	C-T	Homo
SBS	Chr3	31923776	G-T	Homo
SBS	Chr4	16773166	G-T	HET
SBS	Chr5	6779155	C-T	HET
SBS	Chr6	8704330	G-A	HET
SBS	Chr6	12991107	G-A	HET
SBS	Chr6	19462221	T-A	HET
SBS	Chr6	20084297	C-G	HET
SBS	Chr6	29349724	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g48510
SBS	Chr7	2733849	G-A	HET
SBS	Chr7	26195002	C-T	HET
SBS	Chr7	27276651	G-A	HET
SBS	Chr8	2316747	C-T	HET
SBS	Chr8	8337484	T-C	HET
SBS	Chr8	20893871	T-C	HET
SBS	Chr9	6788620	G-T	HET
SBS	Chr9	10453542	C-G	HET
SBS	Chr9	13099024	G-A	HET
SBS	Chr9	16563596	T-C	HET
SBS	Chr9	19762328	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g33510
SBS	Chr10	7405076	A-G	HET
SBS	Chr10	19605380	G-A	HET
SBS	Chr11	9052185	T-C	Homo
SBS	Chr11	24871543	G-A	Homo
SBS	Chr12	18204415	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g30320
SBS	Chr12	20147170	G-T	HET
SBS	Chr12	22945710	G-C	HET

Deletions: 13

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	1545615	1545617	2
Deletion	Chr6	7084528	7084530	2
Deletion	Chr1	10676514	10676519	5
Deletion	Chr3	13108268	13108281	13
Deletion	Chr2	13685387	13685870	483
Deletion	Chr4	15120708	15120713	5	LOC_Os04g25980
Deletion	Chr6	15470602	15470757	155
Deletion	Chr4	22248206	22248210	4
Deletion	Chr1	22678826	22678828	2
Deletion	Chr3	22899867	22899869	2
Deletion	Chr8	27679434	27679439	5
Deletion	Chr11	28631248	28631249	1
Deletion	Chr4	34951524	34951529	5

Insertions: 6

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr2	2106504	2106505	2
Insertion	Chr2	32770915	32770916	2
Insertion	Chr7	4124573	4124574	2
Insertion	Chr3	7180630	7180635	6
Insertion	Chr7	10245932	10245932	1
Insertion	Chr8	18912894	18912919	26

Inversions: 18

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr7	2796076	2796650	LOC_Os07g05810
Inversion	Chr4	3281647	3281984
Inversion	Chr4	3281759	3282065
Inversion	Chr12	3571976	3572097	LOC_Os12g07260
Inversion	Chr1	3920908	3921243
Inversion	Chr5	5899884	5900187
Inversion	Chr6	7225898	7226013	LOC_Os06g13180
Inversion	Chr1	8355646	8355819
Inversion	Chr10	9836460	9836667
Inversion	Chr5	17380666	17380935	LOC_Os05g30030
Inversion	Chr1	17977434	17977571
Inversion	Chr9	19941391	19941541
Inversion	Chr2	20622415	20622518
Inversion	Chr6	22487432	22521001
Inversion	Chr6	24095380	24095644	LOC_Os06g40450
Inversion	Chr7	26107802	26108052	LOC_Os07g43610
Inversion	Chr1	27119487	27119692	LOC_Os01g47450
Inversion	Chr2	30021428	30021669	LOC_Os02g49090

Translocations: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr9	4333540	Chr2	35454745
Translocation	Chr7	4604520	Chr1	7703824
Translocation	Chr11	5448073	Chr10	15969732	2

Main menu