Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 34

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	10476898	G-A	HET
SBS	Chr1	10868547	T-C	HET
SBS	Chr1	13299714	A-C	HET
SBS	Chr1	30674806	T-A	HET
SBS	Chr1	38580814	G-T	HET
SBS	Chr2	10660985	C-T	HET
SBS	Chr2	26408548	T-A	HET
SBS	Chr3	19943317	T-A	HET
SBS	Chr3	32312070	G-A	Homo
SBS	Chr4	21994652	A-G	HET
SBS	Chr5	6423631	C-T	HET
SBS	Chr5	9151564	C-A	HET
SBS	Chr5	12058058	A-T	HET
SBS	Chr5	17468715	C-A	HET
SBS	Chr7	7383628	C-T	HET
SBS	Chr7	17070887	C-G	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g29160
SBS	Chr7	22249476	T-C	HET
SBS	Chr7	23537892	A-T	HET
SBS	Chr8	8678660	G-A	HET
SBS	Chr8	13841763	T-A	HET
SBS	Chr8	17158973	T-C	HET
SBS	Chr9	2727335	C-A	HET
SBS	Chr9	4339880	G-T	Homo
SBS	Chr9	8322885	A-G	HET
SBS	Chr9	9684611	G-A	HET
SBS	Chr10	3490013	C-T	HET
SBS	Chr10	5452793	C-T	HET
SBS	Chr10	14308622	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g27150
SBS	Chr11	4847875	G-A	HET
SBS	Chr11	26377679	G-A	Homo
SBS	Chr12	551690	C-T	HET
SBS	Chr12	8411898	A-C	HET
SBS	Chr12	14601181	A-G	HET
SBS	Chr12	16461198	C-G	HET

Deletions: 9

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr12	1780333	1780334	1
Deletion	Chr9	1977223	1977226	3
Deletion	Chr8	4275825	4275826	1
Deletion	Chr10	11810981	11810982	1
Deletion	Chr3	15973306	15973309	3
Deletion	Chr3	21776121	21776124	3	LOC_Os03g39210
Deletion	Chr11	22021377	22021378	1
Deletion	Chr7	23691001	23770000	78999	12
Deletion	Chr1	39306982	39306983	1

Insertions: 9

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr2	23843011	23843012	2
Insertion	Chr4	22800066	22800067	2
Insertion	Chr2	21913119	21913119	1	LOC_Os02g36290
Insertion	Chr4	3379819	3379821	3	LOC_Os04g06430
Insertion	Chr4	15273890	15273890	1
Insertion	Chr7	19142200	19142201	2	LOC_Os07g32220
Insertion	Chr7	24941088	24941088	1
Insertion	Chr8	9908420	9908420	1
Insertion	Chr10	15485510	15485510	1

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr6	5681168	5681401	LOC_Os06g10880
Inversion	Chr4	17080012	17869576
Inversion	Chr4	26802923	26803121

Translocations: 11

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr8	5422912	Chr5	27325440	LOC_Os08g09350
Translocation	Chr8	5599295	Chr5	27325446	LOC_Os08g09690
Translocation	Chr8	10057881	Chr6	11312971	2
Translocation	Chr5	11149282	Chr4	17545687	2
Translocation	Chr2	13467142	Chr1	26060857	2
Translocation	Chr5	14988874	Chr4	8427374	2
Translocation	Chr7	16356606	Chr3	25791606	2
Translocation	Chr4	23262291	Chr3	25811015
Translocation	Chr12	24160403	Chr3	8413587	2
Translocation	Chr8	27573407	Chr2	30232422	2
Translocation	Chr6	31242974	Chr4	32540342	2

Main menu