Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 48

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	8180671	A-G	HET
SBS	Chr1	12461868	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g22170
SBS	Chr1	17116817	G-A	HET
SBS	Chr1	21169430	T-G	HET
SBS	Chr1	21169431	A-G	HET
SBS	Chr1	25115789	G-A	HET
SBS	Chr1	29240426	A-T	HET
SBS	Chr1	35328389	C-T	HET
SBS	Chr1	37656377	C-G	HET
SBS	Chr2	1198913	C-A	HET
SBS	Chr2	11435831	C-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g19570
SBS	Chr2	23152631	A-G	HET
SBS	Chr2	29096378	C-T	Homo
SBS	Chr3	12832018	A-G	HET
SBS	Chr3	21271953	T-A	HET
SBS	Chr3	25563639	A-G	HET
SBS	Chr3	33981225	T-A	HET
SBS	Chr3	35662989	G-A	HET
SBS	Chr3	35662990	G-A	HET
SBS	Chr4	3145368	G-A	HET
SBS	Chr4	9810818	C-T	Homo
SBS	Chr4	12316754	C-A	Homo
SBS	Chr4	18395644	C-T	Homo
SBS	Chr5	12922910	C-T	Homo
SBS	Chr5	14986169	G-A	Homo
SBS	Chr5	15506027	T-A	Homo
SBS	Chr5	25876862	T-C	Homo
SBS	Chr6	3008456	T-A	HET
SBS	Chr7	23844233	A-G	HET
SBS	Chr7	24666409	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g41200
SBS	Chr7	25219104	T-C	HET
SBS	Chr7	25632477	C-T	HET
SBS	Chr8	5227375	A-G	HET
SBS	Chr8	8236767	C-T	HET
SBS	Chr8	15153338	C-T	HET
SBS	Chr8	23084427	C-T	Homo
SBS	Chr10	2985588	C-T	HET
SBS	Chr10	8818738	C-T	HET
SBS	Chr10	10419920	G-A	HET
SBS	Chr10	11256977	A-G	HET
SBS	Chr10	12427593	A-G	HET
SBS	Chr11	4879410	T-C	HET
SBS	Chr11	9230302	C-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g16640
SBS	Chr11	13746950	T-C	HET
SBS	Chr11	15988204	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g27770
SBS	Chr11	24179421	C-T	HET
SBS	Chr12	3283881	A-G	HET
SBS	Chr12	13420569	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g23640

Deletions: 12

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Deletion	Chr1	1819920	1819922	2
Deletion	Chr10	3477615	3477616	1
Deletion	Chr12	4568127	4568128	1
Deletion	Chr10	6817709	6817721	12
Deletion	Chr3	8082168	8082179	11
Deletion	Chr2	11892041	11892051	10
Deletion	Chr6	12178952	12178953	1
Deletion	Chr10	12336907	12336908	1
Deletion	Chr9	13233798	13233800	2
Deletion	Chr9	18787299	18787300	1
Deletion	Chr6	25250430	25250470	40
Deletion	Chr4	27594280	27594281	1

Insertions: 8

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr3	13601055	13601056	2
Insertion	Chr3	29603664	29603665	2
Insertion	Chr3	30677289	30677290	2
Insertion	Chr3	25249297	25249297	1
Insertion	Chr5	9337406	9337406	1
Insertion	Chr7	11715053	11715068	16
Insertion	Chr10	5512940	5512940	1
Insertion	Chr10	18986169	18986169	1

Inversions: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr9	9107148	9541174	LOC_Os09g15060
Inversion	Chr10	15585720	15657462
Inversion	Chr10	16532244	16682271
Inversion	Chr8	16999242	17095841

Translocations: 14

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr9	1100908	Chr2	2674024
Translocation	Chr4	5215507	Chr1	1044499	LOC_Os04g09720
Translocation	Chr5	6371330	Chr4	16078918
Translocation	Chr10	7621619	Chr5	17252612
Translocation	Chr7	8261476	Chr3	18185027
Translocation	Chr9	9107166	Chr7	26204442	LOC_Os09g15060
Translocation	Chr9	9541194	Chr7	26196650
Translocation	Chr8	10828772	Chr4	21079446
Translocation	Chr11	13416165	Chr4	1508364	2
Translocation	Chr11	15746022	Chr1	2790029	2
Translocation	Chr7	23081188	Chr2	1820235	LOC_Os07g38400
Translocation	Chr7	23370711	Chr2	19766043	LOC_Os07g38980
Translocation	Chr11	25314483	Chr8	8662999
Translocation	Chr2	27133113	Chr1	25821321

Main menu