Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 42

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3905569	T-A	HET
SBS	Chr1	11616833	C-T	HET
SBS	Chr1	23980950	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g42294
SBS	Chr1	24330842	A-T	HET
SBS	Chr1	29765020	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g51754
SBS	Chr1	30921868	T-G	HET
SBS	Chr1	37925662	C-T	HET
SBS	Chr2	10738164	C-A	Homo
SBS	Chr2	12968598	T-C	Homo
SBS	Chr2	13316620	T-C	HET
SBS	Chr2	16009406	C-A	Homo
SBS	Chr2	33226139	C-A	Homo
SBS	Chr3	23872289	A-G	HET
SBS	Chr4	4902647	G-A	HET
SBS	Chr4	5526101	C-T	HET
SBS	Chr4	19562753	A-G	HET
SBS	Chr4	22407532	C-T	HET
SBS	Chr5	4954920	G-T	Homo
SBS	Chr5	14738871	T-C	HET
SBS	Chr6	532828	C-T	Homo
SBS	Chr6	5149603	T-C	Homo
SBS	Chr6	14270898	C-T	HET
SBS	Chr6	16393294	T-C	HET
SBS	Chr6	27071622	T-A	HET
SBS	Chr6	27071623	G-A	HET
SBS	Chr6	27071625	T-A	HET
SBS	Chr7	18011209	G-T	HET
SBS	Chr7	19019728	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g31980
SBS	Chr8	13286583	C-G	Homo
SBS	Chr8	22846911	G-A	HET
SBS	Chr9	1363584	C-T	HET
SBS	Chr9	3225277	G-A	HET
SBS	Chr10	5607841	T-A	HET
SBS	Chr10	13944239	C-T	HET
SBS	Chr10	21564850	A-G	HET
SBS	Chr11	5610413	G-T	HET
SBS	Chr11	5743942	C-T	HET
SBS	Chr11	10604359	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g18720
SBS	Chr11	14800214	C-T	HET
SBS	Chr12	1505801	G-T	HET
SBS	Chr12	4505540	T-C	HET
SBS	Chr12	23900335	T-A	Homo

Deletions: 9

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	1463122	1463123	1	LOC_Os07g03630
Deletion	Chr6	6671542	6671543	1
Deletion	Chr8	8130054	8130056	2
Deletion	Chr7	11368001	11390000	21999	3
Deletion	Chr7	11615001	11656000	40999	11
Deletion	Chr7	11661001	11777000	115999	19
Deletion	Chr11	24001839	24001848	9
Deletion	Chr8	25558402	25558405	3	LOC_Os08g40370
Deletion	Chr2	31336745	31336780	35

Insertions: 8

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr5	169904	169909	6
Insertion	Chr3	14954821	14954827	7
Insertion	Chr4	7947891	7947891	1
Insertion	Chr4	10884121	10884122	2
Insertion	Chr8	20957028	20957028	1
Insertion	Chr9	13801855	13801855	1
Insertion	Chr10	6889707	6889725	19
Insertion	Chr10	8162696	8162696	1

Inversions: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr7	12529395	12539806

Translocations: 12

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr6	1800423	Chr1	34373468
Translocation	Chr7	11356048	Chr2	12933531
Translocation	Chr7	11364355	Chr2	12933513
Translocation	Chr3	14993935	Chr2	24252965	LOC_Os03g26200
Translocation	Chr9	15112975	Chr1	5474338
Translocation	Chr11	15714483	Chr8	18521709	LOC_Os11g27329
Translocation	Chr8	16263154	Chr6	15882909	2
Translocation	Chr12	16442608	Chr10	14901529	LOC_Os12g27890
Translocation	Chr10	16820917	Chr1	41587105
Translocation	Chr5	20611771	Chr2	34284792
Translocation	Chr5	20612689	Chr2	34284787
Translocation	Chr8	23737584	Chr7	23854829

Main menu