Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 41

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	19000566	G-A	HET
SBS	Chr1	19348851	C-T	HET
SBS	Chr1	21516121	T-C	HET
SBS	Chr1	24832974	A-G	HET
SBS	Chr1	31793625	C-G	HET
SBS	Chr1	34292685	C-T	HET
SBS	Chr1	35587936	G-A	HET
SBS	Chr1	35587937	C-A	HET
SBS	Chr1	36098883	A-G	HET
SBS	Chr2	2533960	T-C	Homo
SBS	Chr2	31780095	T-A	Homo
SBS	Chr3	3997072	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g07850
SBS	Chr3	17697264	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g31060
SBS	Chr3	23997617	C-T	Homo
SBS	Chr3	31268463	A-T	HET
SBS	Chr4	2992540	A-T	HET
SBS	Chr4	7670562	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g13750
SBS	Chr4	9265553	C-A	HET
SBS	Chr4	11391316	C-T	HET
SBS	Chr4	11391338	C-G	HET
SBS	Chr4	20573824	A-G	HET
SBS	Chr4	24578261	A-G	HET
SBS	Chr4	24901277	G-T	HET
SBS	Chr5	4463793	C-T	HET
SBS	Chr5	9271925	A-T	HET
SBS	Chr6	10863310	T-C	HET
SBS	Chr7	10714287	G-A	HET
SBS	Chr7	13764602	T-A	HET
SBS	Chr7	18805345	T-C	HET
SBS	Chr7	22962135	T-G	Homo
SBS	Chr8	960735	G-A	HET
SBS	Chr8	8716400	T-C	HET
SBS	Chr8	10887487	G-A	HET
SBS	Chr9	4928291	A-G	HET
SBS	Chr9	4959528	T-A	HET
SBS	Chr9	6174783	A-T	HET
SBS	Chr10	21146506	T-C	HET
SBS	Chr11	11277351	T-C	Homo
SBS	Chr11	15414562	G-A	HET
SBS	Chr11	18020406	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g30970
SBS	Chr12	14274366	G-A	HET

Deletions: 8

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr3	745730	745733	3
Deletion	Chr4	6073136	6073137	1	LOC_Os04g11170
Deletion	Chr5	8849186	8849191	5
Deletion	Chr2	9674621	9674623	2	LOC_Os02g16960
Deletion	Chr11	16329001	16482000	152999	21
Deletion	Chr7	25485828	25485855	27
Deletion	Chr7	25876994	25876999	5
Deletion	Chr3	26527096	26527097	1	LOC_Os03g46910

Insertions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr3	35845948	35845948	1
Insertion	Chr6	1193858	1193858	1

Inversions: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr7	12973387	13008295	2
Inversion	Chr10	20081964	20569790	LOC_Os10g37500
Inversion	Chr1	23073474	23163470	2
Inversion	Chr1	23073476	23163469	2

Translocations: 11

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr12	5124038	Chr1	8155925
Translocation	Chr8	9908690	Chr4	14224716
Translocation	Chr11	10218476	Chr2	2716298
Translocation	Chr7	17647048	Chr6	22526242
Translocation	Chr10	20081947	Chr2	21004330	2
Translocation	Chr10	20569722	Chr2	21004175	2
Translocation	Chr7	20695314	Chr4	6012773
Translocation	Chr2	22702345	Chr1	11397326
Translocation	Chr8	24135950	Chr5	24128204	2
Translocation	Chr8	24135953	Chr5	24117961	2
Translocation	Chr8	27625769	Chr3	8424106

Main menu