Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 41

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	40447378	T-C	HET
SBS	Chr2	5497284	G-A	HET
SBS	Chr2	8521974	C-T	HET
SBS	Chr2	13086238	G-A	HET
SBS	Chr2	33257175	C-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g54254
SBS	Chr3	2982305	T-C	Homo
SBS	Chr3	11234114	A-T	HET
SBS	Chr3	18903681	C-T	HET
SBS	Chr3	19799884	G-A	HET
SBS	Chr3	27927842	G-A	Homo
SBS	Chr4	1323780	G-A	HET
SBS	Chr4	10590601	G-T	HET
SBS	Chr4	17470440	C-A	HET
SBS	Chr4	27945779	A-T	HET
SBS	Chr4	27945780	T-G	HET
SBS	Chr4	27945781	C-T	HET
SBS	Chr4	29244980	G-A	HET
SBS	Chr4	33170973	A-G	HET
SBS	Chr5	4681133	A-T	HET
SBS	Chr5	8145897	A-C	HET
SBS	Chr5	18215786	A-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g31340
SBS	Chr5	18218785	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g31340
SBS	Chr5	18728997	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g32120
SBS	Chr5	21194951	G-A	HET
SBS	Chr6	4157558	C-T	HET
SBS	Chr7	13563189	C-T	HET
SBS	Chr7	17475214	A-T	HET
SBS	Chr7	17475217	A-T	HET
SBS	Chr7	17698770	C-G	HET
SBS	Chr7	21824239	G-C	HET
SBS	Chr9	2205532	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g04190
SBS	Chr9	7396019	C-T	HET
SBS	Chr9	13119108	A-G	HET
SBS	Chr9	22523080	G-T	HET
SBS	Chr10	10683628	C-G	HET
SBS	Chr10	11098643	C-T	HET
SBS	Chr10	15014765	T-A	HET
SBS	Chr11	14183016	G-A	Homo
SBS	Chr12	1729948	T-G	HET
SBS	Chr12	4253986	T-C	HET
SBS	Chr12	9641933	A-G	HET

Deletions: 10

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr8	1076123	1076136	13
Deletion	Chr11	4010490	4010491	1
Deletion	Chr3	6923679	6923691	12
Deletion	Chr1	10179969	10179974	5
Deletion	Chr1	11019249	11019257	8
Deletion	Chr6	14484001	14503000	18999	4
Deletion	Chr10	18444227	18444240	13
Deletion	Chr12	22566954	22566960	6
Deletion	Chr4	33190001	33199000	8999	2
Deletion	Chr2	34680084	34680094	10

Insertions: 1

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr7	24062143	24062150	8

Inversions: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr2	21569177	21569459	2
Inversion	Chr5	25858423	26010852	2
Inversion	Chr5	25858424	26010851	2
Inversion	Chr4	32755112	33190068	LOC_Os04g55080
Inversion	Chr4	32755123	33199039	2

Translocations: 6

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr6	9473710	Chr3	16475641	2
Translocation	Chr9	12828728	Chr3	15469520	2
Translocation	Chr9	12898826	Chr3	15469533	2
Translocation	Chr2	21791395	Chr1	7790779
Translocation	Chr12	22022335	Chr4	15487890
Translocation	Chr7	24338255	Chr5	22609229

Main menu