Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 51

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	5088645	T-C	HET
SBS	Chr1	18164377	G-A	HET
SBS	Chr1	18164378	T-A	HET
SBS	Chr1	24611135	A-T	HET
SBS	Chr2	4047258	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g07760
SBS	Chr2	4704403	C-T	HET
SBS	Chr2	15747419	C-T	HET
SBS	Chr2	27037453	G-A	HET
SBS	Chr3	143879	C-T	HET
SBS	Chr3	22445297	T-A	HET
SBS	Chr3	22445298	T-A	HET
SBS	Chr3	23398240	C-T	HET
SBS	Chr3	32372026	C-T	HET
SBS	Chr4	3961076	C-G	HET
SBS	Chr4	9086210	C-T	HET
SBS	Chr4	11176508	G-A	HET
SBS	Chr4	11285821	T-A	HET
SBS	Chr4	20823519	T-A	Homo
SBS	Chr5	8413203	G-C	Homo
SBS	Chr5	10308809	T-C	HET
SBS	Chr5	18110371	T-C	HET
SBS	Chr5	19334041	C-T	HET
SBS	Chr5	23648533	A-G	HET
SBS	Chr6	6963894	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g12760
SBS	Chr6	12720702	C-T	Homo
SBS	Chr6	25291979	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g42110
SBS	Chr7	3755728	C-T	HET
SBS	Chr7	7828659	G-A	Homo
SBS	Chr7	12668145	T-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g22520
SBS	Chr7	12668146	C-G	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g22520
SBS	Chr7	14316196	C-T	Homo
SBS	Chr8	10641680	C-T	HET
SBS	Chr8	13777220	G-A	HET
SBS	Chr8	21850607	A-T	HET
SBS	Chr8	21850608	G-T	HET
SBS	Chr8	23208631	C-A	HET
SBS	Chr9	632101	T-C	HET
SBS	Chr9	2295024	A-T	Homo
SBS	Chr9	17248866	G-A	HET
SBS	Chr10	11228152	G-T	HET
SBS	Chr10	17277107	A-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g33000
SBS	Chr10	17900613	G-A	HET
SBS	Chr11	11870139	T-G	HET
SBS	Chr11	15207889	G-A	HET
SBS	Chr11	18049723	G-A	Homo
SBS	Chr11	21364425	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g36280
SBS	Chr12	1066593	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g02900
SBS	Chr12	7405757	C-A	HET
SBS	Chr12	24946185	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g40279
SBS	Chr12	24946186	T-A	HET
SBS	Chr12	26280709	A-G	HET

Deletions: 17

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr3	1000618	1000622	4	LOC_Os03g02680
Deletion	Chr4	2065734	2065735	1
Deletion	Chr6	2561787	2561794	7
Deletion	Chr5	3616375	3616383	8
Deletion	Chr3	3761293	3761300	7
Deletion	Chr9	4263416	4263423	7	LOC_Os09g08224
Deletion	Chr1	6478547	6478554	7
Deletion	Chr4	7976203	7976229	26
Deletion	Chr5	14355891	14355907	16
Deletion	Chr8	16218786	16218793	7
Deletion	Chr8	19083939	19083947	8
Deletion	Chr5	19868234	19868236	2
Deletion	Chr2	21061113	21061119	6	LOC_Os02g35090
Deletion	Chr3	22423970	22423972	2
Deletion	Chr6	22670869	22670876	7
Deletion	Chr5	27804640	27804641	1
Deletion	Chr1	34173335	34173337	2

Insertions: 4

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr5	4000360	4000360	1
Insertion	Chr11	14224874	14224876	3
Insertion	Chr1	20810863	20810863	1
Insertion	Chr3	14987577	14987577	1

Inversions: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr7	6961458	6961713

Translocations: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr12	5124038	Chr1	8155925
Translocation	Chr12	27043817	Chr11	20669201

Main menu