Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 50

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3941299	C-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g08150
SBS	Chr1	3941300	A-T	HET
SBS	Chr1	3964509	A-G	HET
SBS	Chr1	15697978	C-T	Homo
SBS	Chr1	22886957	T-C	Homo
SBS	Chr1	26994345	G-A	HET
SBS	Chr1	28962461	C-T	Homo
SBS	Chr1	34054276	G-A	HET
SBS	Chr1	34373943	A-G	Homo
SBS	Chr1	37410634	A-G	Homo
SBS	Chr1	38953723	G-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g67100
SBS	Chr2	10871050	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g18660
SBS	Chr2	16124670	C-T	HET
SBS	Chr2	22196895	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g36800
SBS	Chr2	22973628	T-C	HET
SBS	Chr3	8784677	T-C	HET
SBS	Chr3	28984926	A-G	Homo
SBS	Chr4	3168544	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g06100
SBS	Chr4	11234513	T-A	HET
SBS	Chr4	13106460	A-G	HET
SBS	Chr4	14547660	G-A	Homo
SBS	Chr4	22477508	C-A	Homo
SBS	Chr5	720645	C-T	HET
SBS	Chr5	8800546	A-C	HET
SBS	Chr5	16676579	G-A	HET
SBS	Chr5	23837168	G-A	HET
SBS	Chr6	15394973	T-C	HET
SBS	Chr6	16545264	C-T	HET
SBS	Chr6	17990148	T-C	HET
SBS	Chr6	26728015	T-A	Homo
SBS	Chr6	26728019	G-A	Homo
SBS	Chr7	13564181	C-T	HET
SBS	Chr8	14487399	C-T	HET
SBS	Chr8	20954182	C-T	HET
SBS	Chr9	1732438	C-T	HET
SBS	Chr9	9343285	T-C	HET
SBS	Chr10	2054975	C-T	HET
SBS	Chr10	4650378	C-T	HET
SBS	Chr10	11287194	A-G	HET
SBS	Chr10	11287195	G-A	HET
SBS	Chr10	19134489	T-C	HET
SBS	Chr11	8817025	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g15560
SBS	Chr11	9589383	C-T	HET
SBS	Chr11	13768591	T-C	Homo
SBS	Chr11	15376384	C-G	HET
SBS	Chr11	20002590	C-T	Homo
SBS	Chr12	8681893	A-G	HET
SBS	Chr12	9002417	G-A	HET
SBS	Chr12	13359822	G-A	HET
SBS	Chr12	15572998	C-T	HET

Deletions: 32

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr11	192672	192684	12
Deletion	Chr3	1496936	1496972	36	LOC_Os03g03460
Deletion	Chr5	2301679	2301683	4
Deletion	Chr1	2650176	2650342	166
Deletion	Chr1	3064131	3064133	2	LOC_Os01g06510
Deletion	Chr3	3551284	3551296	12
Deletion	Chr7	4055997	4055998	1
Deletion	Chr5	5117337	5117338	1
Deletion	Chr6	5308449	5308455	6
Deletion	Chr6	6837001	6873000	35999	2
Deletion	Chr6	6874001	6885000	10999	LOC_Os06g12620
Deletion	Chr3	6921790	6921797	7
Deletion	Chr12	10813382	10813386	4
Deletion	Chr7	10954089	10954090	1
Deletion	Chr2	12310763	12310769	6
Deletion	Chr9	14104647	14104663	16
Deletion	Chr6	15219889	15219893	4	LOC_Os06g25990
Deletion	Chr5	15458053	15458073	20
Deletion	Chr9	16022951	16022954	3
Deletion	Chr12	17647108	17647109	1
Deletion	Chr7	19875693	19875698	5	LOC_Os07g33260
Deletion	Chr3	21666706	21666720	14
Deletion	Chr2	23397527	23397529	2
Deletion	Chr6	26547805	26547813	8
Deletion	Chr11	26706317	26706333	16
Deletion	Chr3	26960537	26960546	9
Deletion	Chr8	27625588	27625590	2
Deletion	Chr7	29255001	29283000	27999	6
Deletion	Chr7	29403554	29403567	13
Deletion	Chr2	33762187	33762192	5
Deletion	Chr3	36091320	36091335	15
Deletion	Chr1	37487088	37487098	10

Insertions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr12	20273415	20273416	2
Insertion	Chr11	4548519	4548530	12

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr4	25833143	25904360	LOC_Os04g43660
Inversion	Chr4	25833158	25904370	LOC_Os04g43660

Translocations: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2
Translocation	Chr5	1053180	Chr4	31356447
Translocation	Chr5	1066713	Chr4	31356461
Translocation	Chr10	9492675	Chr4	13787584

Main menu