Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 41

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	12419990	C-G	HET
SBS	Chr1	21891792	C-T	HET
SBS	Chr1	23958273	G-T	HET
SBS	Chr1	24206313	C-T	HET
SBS	Chr2	229620	C-G	HET
SBS	Chr2	7062350	T-G	HET
SBS	Chr2	7087110	A-T	HET
SBS	Chr2	7087111	C-T	HET
SBS	Chr2	11225913	A-G	Homo
SBS	Chr2	11613626	C-T	Homo
SBS	Chr2	15886570	C-T	Homo
SBS	Chr2	17328128	G-A	HET
SBS	Chr2	23162394	T-G	HET
SBS	Chr2	26017269	A-G	HET
SBS	Chr2	33203567	G-A	HET
SBS	Chr3	5011893	G-A	HET
SBS	Chr3	11203755	A-G	HET
SBS	Chr3	13766422	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g24210
SBS	Chr3	21620642	A-T	HET
SBS	Chr3	33922376	G-T	HET
SBS	Chr4	300000	T-A	Homo
SBS	Chr4	1711418	C-T	HET
SBS	Chr4	1967753	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g04220
SBS	Chr4	4963366	G-A	HET
SBS	Chr5	19798461	C-T	HET
SBS	Chr5	23617505	A-G	HET
SBS	Chr5	28781563	G-T	Homo
SBS	Chr7	6949692	C-T	HET
SBS	Chr7	14930732	G-A	HET
SBS	Chr7	15233090	C-G	HET
SBS	Chr8	3178838	T-C	HET
SBS	Chr8	22610947	T-C	HET
SBS	Chr8	26991811	C-T	HET
SBS	Chr10	20511629	C-T	HET
SBS	Chr11	20220873	G-A	HET
SBS	Chr11	22480543	T-C	HET
SBS	Chr11	25272142	G-A	HET
SBS	Chr12	8977418	C-T	HET
SBS	Chr12	12656337	T-A	HET
SBS	Chr12	15184032	C-T	HET
SBS	Chr12	21990357	C-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g35970

Deletions: 15

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr12	1827771	1827772	1	LOC_Os12g04310
Deletion	Chr12	2083733	2083737	4	LOC_Os12g04840
Deletion	Chr11	8600304	8600305	1
Deletion	Chr8	11209419	11210414	995	LOC_Os08g18780
Deletion	Chr5	11479466	11479469	3
Deletion	Chr10	12749761	12749777	16	LOC_Os10g24790
Deletion	Chr8	14004583	14004584	1
Deletion	Chr8	14013596	14013604	8
Deletion	Chr9	14504962	14504967	5
Deletion	Chr9	14736158	14736161	3
Deletion	Chr1	17191145	17191149	4
Deletion	Chr9	19019310	19019321	11
Deletion	Chr10	20947637	20947644	7
Deletion	Chr4	21020197	21020205	8
Deletion	Chr5	24855001	24866000	10999	2

Insertions: 11

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr2	19064618	19064624	7
Insertion	Chr2	19722828	19722834	7
Insertion	Chr3	19259782	19259782	1
Insertion	Chr4	12265757	12265757	1
Insertion	Chr4	22704544	22704544	1
Insertion	Chr5	21807624	21807624	1	LOC_Os05g37270
Insertion	Chr7	6552562	6552562	1
Insertion	Chr7	13579336	13579336	1
Insertion	Chr8	12235654	12235654	1
Insertion	Chr8	15935106	15935106	1
Insertion	Chr11	13568674	13568674	1

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr12	8153346	8648627
Inversion	Chr10	15611376	16606081
Inversion	Chr6	19325455	19860083	LOC_Os06g33190

Translocations: 14

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr9	2681626	Chr2	13953521	2
Translocation	Chr12	5548820	Chr6	8507810	2
Translocation	Chr5	6371342	Chr4	16078895
Translocation	Chr11	8528073	Chr4	15494226
Translocation	Chr12	9487778	Chr6	12598601
Translocation	Chr11	10816008	Chr1	19980910	2
Translocation	Chr8	14049738	Chr5	7307158	2
Translocation	Chr8	14996783	Chr1	41858429
Translocation	Chr8	17921490	Chr5	12103301	2
Translocation	Chr10	18643788	Chr8	22924403	2
Translocation	Chr7	20707380	Chr6	518707	LOC_Os07g34540
Translocation	Chr6	22476541	Chr1	35285005	2
Translocation	Chr2	22702345	Chr1	11397326
Translocation	Chr11	28757234	Chr8	17178919

Main menu