Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 42

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3986566	C-G	HET
SBS	Chr1	8431899	A-G	HET
SBS	Chr1	19026780	G-A	HET
SBS	Chr1	32590042	C-A	Homo
SBS	Chr1	33651747	C-T	Homo
SBS	Chr2	4760785	G-C	Homo
SBS	Chr2	14099321	T-A	HET
SBS	Chr2	17259792	C-A	Homo
SBS	Chr3	22406050	T-C	Homo
SBS	Chr3	22937259	T-A	HET
SBS	Chr3	34858943	T-C	HET
SBS	Chr4	1684302	C-T	Homo
SBS	Chr4	5418115	G-C	Homo
SBS	Chr4	11591986	T-A	Homo
SBS	Chr4	16036123	C-T	HET
SBS	Chr4	26998384	G-A	HET
SBS	Chr4	35222886	G-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g59210
SBS	Chr5	7510868	C-T	HET
SBS	Chr5	9682597	T-A	Homo
SBS	Chr5	17847811	A-G	HET
SBS	Chr6	6556301	T-A	HET
SBS	Chr6	15685287	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g27700
SBS	Chr6	17754192	T-C	HET
SBS	Chr6	20690471	T-G	HET
SBS	Chr7	15488506	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g26800
SBS	Chr7	25436350	G-T	HET
SBS	Chr8	11903169	G-A	HET
SBS	Chr8	18529740	A-T	Homo
SBS	Chr9	2306047	A-G	HET
SBS	Chr9	8218458	C-T	HET
SBS	Chr9	10068505	A-G	HET
SBS	Chr9	22017924	G-A	HET
SBS	Chr10	1959425	C-A	HET
SBS	Chr10	3818729	A-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g07248
SBS	Chr10	17026706	G-C	Homo
SBS	Chr10	18326818	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g34380
SBS	Chr10	21617304	C-T	HET
SBS	Chr12	5778730	A-G	HET
SBS	Chr12	13261819	G-A	HET
SBS	Chr12	13791989	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g24200
SBS	Chr12	23203756	T-A	HET
SBS	Chr12	25962734	G-A	Homo

Deletions: 9

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	11816206	11816208	2
Deletion	Chr9	12678861	12678862	1	LOC_Os09g21020
Deletion	Chr11	13664622	13664623	1
Deletion	Chr1	16893906	16893907	1
Deletion	Chr11	18956067	18956068	1
Deletion	Chr6	22433238	22433239	1
Deletion	Chr8	23435002	23435006	4
Deletion	Chr8	24820048	24820059	11
Deletion	Chr11	26728041	26728043	2

Insertions: 7

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr6	30986062	30986063	2
Insertion	Chr1	43246283	43246284	2
Insertion	Chr3	8317499	8317499	1
Insertion	Chr4	14979680	14979681	2
Insertion	Chr8	16898110	16898157	48
Insertion	Chr10	4817846	4817847	2
Insertion	Chr12	26091376	26091376	1

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr12	13376069	13403422
Inversion	Chr2	34913568	35011565	2
Inversion	Chr2	34913570	35011565	2

Translocations: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr9	2592228	Chr7	27101173	2
Translocation	Chr6	15837761	Chr1	33152526	2
Translocation	Chr6	16983416	Chr1	33152537	2
Translocation	Chr5	17078863	Chr4	12974522	2
Translocation	Chr7	25127939	Chr2	21836310

Main menu