Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 41

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	1568103	T-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g03730
SBS	Chr1	22671328	C-T	Homo
SBS	Chr2	12001730	A-G	HET
SBS	Chr2	13316313	T-C	HET
SBS	Chr2	13810936	A-T	HET
SBS	Chr2	22839521	A-G	HET
SBS	Chr2	25109602	T-A	HET
SBS	Chr3	26160615	C-T	HET
SBS	Chr3	32307323	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g56700
SBS	Chr3	35660222	A-C	Homo
SBS	Chr4	1304862	C-G	Homo
SBS	Chr4	2772621	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g05480
SBS	Chr4	9763165	A-G	HET
SBS	Chr5	5199604	T-C	HET
SBS	Chr5	7543483	G-A	HET
SBS	Chr5	7663366	G-A	HET
SBS	Chr5	13677550	A-C	HET
SBS	Chr5	17417524	T-C	HET
SBS	Chr5	17430373	C-G	HET
SBS	Chr5	29004962	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g50600
SBS	Chr6	5316846	G-T	HET
SBS	Chr6	7862343	C-T	Homo
SBS	Chr6	20884319	A-T	HET
SBS	Chr6	29451965	A-G	HET
SBS	Chr7	4090348	A-G	HET
SBS	Chr7	6984113	C-T	HET
SBS	Chr8	2988189	G-C	Homo
SBS	Chr9	1494201	T-A	HET
SBS	Chr9	2452362	C-T	HET
SBS	Chr9	11974091	A-T	Homo
SBS	Chr9	12327031	C-T	Homo
SBS	Chr10	4599368	A-T	HET
SBS	Chr10	8810413	C-T	HET
SBS	Chr10	12001228	T-A	HET
SBS	Chr10	22435765	G-T	HET
SBS	Chr11	11473574	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g19930
SBS	Chr11	13432045	T-C	HET
SBS	Chr11	14879432	A-T	HET
SBS	Chr12	9490430	T-A	Homo
SBS	Chr12	9490431	G-A	Homo
SBS	Chr12	12588262	T-A	HET

Deletions: 20

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr4	500060	500061	1
Deletion	Chr8	1018708	1018724	16
Deletion	Chr6	11064699	11064704	5
Deletion	Chr10	14351439	14351443	4
Deletion	Chr5	15343001	15386000	42999	6
Deletion	Chr7	17962451	17962458	7
Deletion	Chr1	19064941	19064952	11
Deletion	Chr6	19597819	19597829	10
Deletion	Chr8	20443001	20540000	96999	13
Deletion	Chr8	20547001	20868000	320999	39
Deletion	Chr8	20870001	20907000	36999	5
Deletion	Chr8	20918001	20997000	78999	11
Deletion	Chr10	21270290	21270299	9
Deletion	Chr4	25489203	25489205	2
Deletion	Chr2	25878122	25878131	9
Deletion	Chr7	27080116	27080123	7	LOC_Os07g45400
Deletion	Chr6	28584378	28584388	10
Deletion	Chr3	32101935	32101943	8
Deletion	Chr3	32289781	32289789	8
Deletion	Chr4	33301001	33310000	8999	LOC_Os04g55920

Insertions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr1	28134646	28134647	2
Insertion	Chr3	11175119	11175119	1

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr11	2908373	3599767	LOC_Os11g06110
Inversion	Chr11	2908381	3599766	LOC_Os11g06110

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr11	5309909	Chr5	12212724	2
Translocation	Chr2	9036851	Chr1	16043507
Translocation	Chr7	18524668	Chr4	33300987
Translocation	Chr7	18524672	Chr4	33310123	2

Main menu