Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 38

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	18858350	T-C	HET
SBS	Chr1	23421935	A-T	HET
SBS	Chr1	23492739	T-G	HET
SBS	Chr1	28234171	C-A	HET
SBS	Chr1	39403082	C-T	HET
SBS	Chr1	42703258	T-C	HET
SBS	Chr2	2837958	A-T	HET
SBS	Chr2	8764778	A-G	HET
SBS	Chr2	12181085	C-T	HET
SBS	Chr2	12845071	G-A	Homo
SBS	Chr2	25898426	G-A	Homo
SBS	Chr2	31632779	T-C	HET
SBS	Chr2	31827686	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g51980
SBS	Chr2	34523469	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g56390
SBS	Chr3	12783240	A-T	Homo
SBS	Chr3	29409536	G-A	Homo
SBS	Chr4	7169593	G-T	Homo
SBS	Chr4	10850268	G-T	HET
SBS	Chr4	11286342	G-T	HET
SBS	Chr4	33607823	G-A	HET
SBS	Chr5	4030069	A-G	Homo
SBS	Chr5	12510726	G-A	HET
SBS	Chr5	14300374	G-A	HET
SBS	Chr5	25251009	G-A	HET
SBS	Chr7	602767	G-A	HET
SBS	Chr7	20316497	T-C	Homo
SBS	Chr8	11536997	T-G	HET
SBS	Chr8	18750029	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g30460
SBS	Chr9	22128673	G-C	HET
SBS	Chr11	689052	C-T	Homo
SBS	Chr11	21979644	T-A	HET
SBS	Chr11	21979645	C-A	HET
SBS	Chr12	14897299	T-C	HET
SBS	Chr12	23244173	C-T	HET
SBS	Chr12	23802777	T-C	HET
SBS	Chr12	24862899	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g40170
SBS	Chr12	24868153	C-T	HET
SBS	Chr12	25084838	T-G	HET

Deletions: 17

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	2223932	2223933	1
Deletion	Chr12	4331527	4331547	20
Deletion	Chr3	6327001	6344000	16999	2
Deletion	Chr1	6435242	6435254	12
Deletion	Chr8	8005652	8005655	3
Deletion	Chr4	8303900	8303906	6
Deletion	Chr3	11911556	11911563	7
Deletion	Chr10	12577620	12577622	2
Deletion	Chr7	15130093	15130095	2
Deletion	Chr10	18084777	18084783	6
Deletion	Chr10	18662001	18683000	20999	6
Deletion	Chr3	19379853	19379881	28
Deletion	Chr6	21221720	21221726	6
Deletion	Chr6	21499315	21499316	1
Deletion	Chr7	23392000	23392006	6
Deletion	Chr4	33052405	33052408	3
Deletion	Chr3	34512991	34512996	5

Insertions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr2	11491965	11491966	2
Insertion	Chr7	16836657	16836657	1	LOC_Os07g28760

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr3	5652880	5674417	2
Inversion	Chr3	5652901	5674418	2

Translocations: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr10	12733661	Chr8	9303439	2
Translocation	Chr9	16352974	Chr2	5420603
Translocation	Chr11	28430661	Chr8	2834627	2

Main menu