Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 40

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	11559019	C-G	Homo
SBS	Chr1	17099704	G-A	HET
SBS	Chr1	29449382	T-A	HET
SBS	Chr1	29449383	A-C	HET
SBS	Chr1	29906851	C-T	HET
SBS	Chr2	475945	A-T	HET
SBS	Chr2	4391368	C-T	HET
SBS	Chr2	10253984	G-A	HET
SBS	Chr2	17261328	C-T	Homo
SBS	Chr2	24797048	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g40920
SBS	Chr2	34769223	G-T	HET
SBS	Chr3	12608650	G-A	HET
SBS	Chr3	12742835	A-T	HET
SBS	Chr3	19090591	T-G	HET
SBS	Chr3	29575922	A-T	HET
SBS	Chr4	3024265	C-T	HET
SBS	Chr4	16391112	G-A	HET
SBS	Chr4	31185515	G-A	HET
SBS	Chr4	31890487	G-A	HET
SBS	Chr4	34455195	C-T	HET
SBS	Chr5	5243299	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g09360
SBS	Chr5	5243300	C-A	HET
SBS	Chr5	29112268	T-A	Homo
SBS	Chr5	29112269	G-A	Homo
SBS	Chr6	994243	T-C	HET
SBS	Chr6	4727278	A-C	HET
SBS	Chr6	6575138	A-C	HET
SBS	Chr6	10907339	A-G	HET
SBS	Chr6	10984956	T-C	HET
SBS	Chr7	14891350	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g25950
SBS	Chr7	26525904	C-A	HET
SBS	Chr8	9655599	T-C	Homo
SBS	Chr9	6755067	G-C	HET
SBS	Chr10	5175955	C-T	Homo
SBS	Chr10	13465647	C-T	HET
SBS	Chr11	10525306	C-A	Homo
SBS	Chr11	10862593	A-C	HET
SBS	Chr11	17293421	A-G	HET
SBS	Chr11	17913994	A-T	HET
SBS	Chr12	16279402	T-C	HET

Deletions: 11

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr4	306066	306067	1
Deletion	Chr6	1209001	1325000	115999	26
Deletion	Chr7	7076239	7076243	4
Deletion	Chr3	8720001	8743000	22999	5
Deletion	Chr5	12382292	12382293	1
Deletion	Chr1	13708150	13708161	11
Deletion	Chr12	15010388	15010390	2
Deletion	Chr2	18758570	18758571	1
Deletion	Chr5	20713380	20713385	5
Deletion	Chr3	21462256	21462257	1
Deletion	Chr7	21865171	21865172	1

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr5	5273585	5273586	2
Insertion	Chr5	13840627	13840628	2
Insertion	Chr8	5914608	5914627	20

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr5	9046123	9625630
Inversion	Chr5	9625647	9679726	2

Translocations: 11

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr10	2018272	Chr5	17162018	2
Translocation	Chr11	3680082	Chr8	1215913
Translocation	Chr12	5779287	Chr8	19753812
Translocation	Chr11	8196297	Chr4	13912048
Translocation	Chr5	10267145	Chr1	20043979	2
Translocation	Chr11	16590731	Chr6	27543274	2
Translocation	Chr4	16721353	Chr2	10395995
Translocation	Chr10	17323126	Chr1	23664817
Translocation	Chr6	23437421	Chr4	33991189
Translocation	Chr6	23460932	Chr5	23223187	LOC_Os06g39515
Translocation	Chr7	28618365	Chr2	15666775

Main menu