Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 48

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	2611629	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g05500
SBS	Chr1	14486774	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g25560
SBS	Chr1	15318816	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g27440
SBS	Chr1	21774970	A-C	HET
SBS	Chr1	25821298	G-A	HET
SBS	Chr1	34062470	G-A	HET
SBS	Chr2	42788	G-A	HET
SBS	Chr2	3860964	G-A	HET
SBS	Chr2	23160778	A-G	HET
SBS	Chr2	26109605	A-G	HET
SBS	Chr2	26217822	C-T	Homo
SBS	Chr2	31247619	C-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g51080
SBS	Chr3	9597053	T-A	HET
SBS	Chr3	11315867	G-A	HET
SBS	Chr3	20789722	G-T	HET
SBS	Chr3	23222227	T-C	HET
SBS	Chr3	24103106	C-T	HET
SBS	Chr3	35056286	T-A	HET
SBS	Chr4	1449932	C-A	HET
SBS	Chr4	2881216	C-A	HET
SBS	Chr4	19879224	G-A	HET
SBS	Chr4	23333370	A-G	HET
SBS	Chr5	955687	A-T	HET
SBS	Chr5	955691	A-T	HET
SBS	Chr5	3092641	C-A	HET
SBS	Chr5	6318250	A-T	HET
SBS	Chr5	15923313	C-T	HET
SBS	Chr5	20644769	A-T	HET
SBS	Chr5	20644770	G-T	HET
SBS	Chr5	26957934	A-G	HET
SBS	Chr6	4270214	G-T	HET
SBS	Chr6	4478449	A-T	HET
SBS	Chr6	4478450	G-T	HET
SBS	Chr6	7427999	G-A	HET
SBS	Chr6	24635838	T-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g41170
SBS	Chr7	7844806	C-T	Homo
SBS	Chr7	11459569	C-T	HET
SBS	Chr7	17685387	C-T	Homo
SBS	Chr7	18491421	T-A	HET
SBS	Chr7	27471541	A-T	Homo
SBS	Chr8	6342831	T-C	HET
SBS	Chr8	12451600	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g20720
SBS	Chr10	22825839	G-A	HET
SBS	Chr11	516089	G-A	HET
SBS	Chr11	13269437	G-A	HET
SBS	Chr11	21846086	A-G	HET
SBS	Chr12	17075692	C-A	HET
SBS	Chr12	20713171	G-T	HET

Deletions: 13

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr9	768241	768250	9
Deletion	Chr4	1842792	1842794	2
Deletion	Chr9	4916515	4916518	3
Deletion	Chr7	12819632	12819635	3
Deletion	Chr11	13137001	13205000	67999	13
Deletion	Chr11	14040001	14108000	67999	14
Deletion	Chr11	17866921	17866922	1
Deletion	Chr7	18510327	18510343	16
Deletion	Chr5	18660820	18660825	5
Deletion	Chr6	21110001	21263000	152999	19
Deletion	Chr1	22851067	22851068	1
Deletion	Chr1	24795027	24795033	6
Deletion	Chr6	26418753	26418757	4

Insertions: 4

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr5	4740328	4740357	30	LOC_Os05g08660
Insertion	Chr7	16990876	16990890	15
Insertion	Chr12	16305064	16305064	1
Insertion	Chr12	21737586	21737660	75

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr12	8006038	8828222
Inversion	Chr11	10018907	10421247	2
Inversion	Chr11	10018948	10421256	2

Translocations: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr10	2295850	Chr4	15515482	2
Translocation	Chr12	8313280	Chr1	21755933
Translocation	Chr12	8313425	Chr1	21755922
Translocation	Chr8	12013909	Chr3	23147212	2
Translocation	Chr11	26982433	Chr6	23273074

Main menu