Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 40

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	21079068	C-A	Homo
SBS	Chr1	26475075	A-T	HET
SBS	Chr1	36586510	C-A	HET
SBS	Chr1	41872380	A-G	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g72210
SBS	Chr1	41956479	G-A	Homo
SBS	Chr2	5065123	C-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g09820
SBS	Chr2	34410374	T-C	HET
SBS	Chr3	22843833	C-A	HET
SBS	Chr3	33122697	C-T	Homo
SBS	Chr4	3748614	G-A	HET
SBS	Chr4	4387197	G-A	HET
SBS	Chr4	8657514	G-A	HET
SBS	Chr4	12454414	T-C	HET
SBS	Chr4	20512183	A-G	Homo
SBS	Chr4	25198838	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g42600
SBS	Chr4	26826213	A-G	HET
SBS	Chr5	5950879	A-C	HET
SBS	Chr5	12354281	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g20990
SBS	Chr5	23417403	T-C	HET
SBS	Chr6	200223	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g01320
SBS	Chr6	200227	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g01320
SBS	Chr6	486406	G-A	HET
SBS	Chr6	10929481	C-A	HET
SBS	Chr7	5587852	A-G	HET
SBS	Chr7	10608673	C-T	Homo
SBS	Chr7	10725920	A-T	HET
SBS	Chr7	15447511	T-C	HET
SBS	Chr8	2949481	G-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g05520
SBS	Chr8	27645799	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g43760
SBS	Chr9	1962450	C-T	HET
SBS	Chr9	5527637	C-T	HET
SBS	Chr10	4288572	G-A	HET
SBS	Chr10	4288573	C-A	HET
SBS	Chr10	7209217	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g13350
SBS	Chr10	12098250	A-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g23180
SBS	Chr11	7391556	G-T	Homo
SBS	Chr12	1868906	G-A	HET
SBS	Chr12	8806148	C-T	Homo
SBS	Chr12	17241413	G-A	HET
SBS	Chr12	22013071	A-C	HET

Deletions: 9

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr3	558687	558695	8
Deletion	Chr11	1864062	1864063	1
Deletion	Chr2	5094001	5163000	68999	7
Deletion	Chr11	9014636	9014637	1
Deletion	Chr6	13408951	13408959	8
Deletion	Chr7	14141612	14141613	1
Deletion	Chr9	17561699	17561700	1
Deletion	Chr11	20203633	20203634	1
Deletion	Chr1	20447044	20447046	2

Insertions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr2	9287144	9287144	1
Insertion	Chr4	2067626	2067626	1

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr5	6338666	6674595
Inversion	Chr5	6338670	6674593
Inversion	Chr1	13747526	13751097	LOC_Os01g24390

Translocations: 8

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr7	3115403	Chr5	24535893
Translocation	Chr10	4321935	Chr5	3174814
Translocation	Chr12	6098402	Chr11	1001717	2
Translocation	Chr7	15231629	Chr2	13980963	2
Translocation	Chr7	15231636	Chr2	13979595	2
Translocation	Chr12	20178690	Chr2	17732469
Translocation	Chr11	22921913	Chr7	8233720
Translocation	Chr5	25539359	Chr1	40623925

Main menu