Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 49

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3393632	G-A	Homo
SBS	Chr1	12111614	T-A	HET
SBS	Chr1	13505043	A-G	HET
SBS	Chr1	17600549	C-A	HET	STOP_GAINED	LOC_Os01g32160
SBS	Chr1	20172679	C-T	HET
SBS	Chr1	25247238	A-T	HET
SBS	Chr1	41589026	C-T	HET
SBS	Chr2	1252088	C-T	HET
SBS	Chr2	12437812	T-G	Homo
SBS	Chr2	33009426	C-T	HET
SBS	Chr2	33964252	T-G	HET
SBS	Chr3	7020476	G-A	HET
SBS	Chr3	13272135	C-T	HET
SBS	Chr3	22624082	T-A	HET
SBS	Chr3	35176378	G-T	Homo
SBS	Chr3	35298996	G-A	HET
SBS	Chr4	23524604	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g39510
SBS	Chr4	25683360	A-G	HET
SBS	Chr4	27953130	A-G	HET
SBS	Chr5	26497420	G-A	HET
SBS	Chr5	26975942	G-A	HET
SBS	Chr5	28077040	G-A	HET
SBS	Chr6	5191282	G-A	HET
SBS	Chr6	9174497	A-G	Homo
SBS	Chr6	13453245	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g23070
SBS	Chr6	27625799	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g45630
SBS	Chr6	29990143	G-A	HET
SBS	Chr7	5123310	C-T	Homo
SBS	Chr7	7828659	G-A	Homo
SBS	Chr7	28489791	G-T	HET
SBS	Chr8	22481357	C-T	HET
SBS	Chr8	25355502	C-T	HET
SBS	Chr9	3522097	G-A	HET
SBS	Chr9	10027065	G-A	HET
SBS	Chr9	19047716	A-G	HET
SBS	Chr9	21624198	G-A	HET
SBS	Chr10	11029483	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g21540
SBS	Chr10	11508907	G-A	HET
SBS	Chr10	18087197	A-G	HET
SBS	Chr11	2888584	G-A	Homo
SBS	Chr11	9992673	C-T	HET
SBS	Chr11	24139602	T-A	HET
SBS	Chr12	2521157	G-A	HET
SBS	Chr12	3443454	T-G	HET
SBS	Chr12	4236762	A-T	HET
SBS	Chr12	4236766	T-C	HET
SBS	Chr12	5317967	C-T	HET
SBS	Chr12	7742864	G-A	HET
SBS	Chr12	17890828	G-A	HET

Deletions: 8

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr4	1394001	1483000	88999	17
Deletion	Chr11	2373439	2373441	2
Deletion	Chr12	3552905	3552910	5
Deletion	Chr11	8654324	8654326	2
Deletion	Chr10	13117777	13117779	2
Deletion	Chr6	17183357	17183364	7
Deletion	Chr6	24981763	24981765	2
Deletion	Chr3	27735178	27735198	20

Insertions: 5

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr2	26118288	26118288	1
Insertion	Chr4	31229861	31229862	2
Insertion	Chr6	5968336	5968336	1
Insertion	Chr6	10663870	10663870	1
Insertion	Chr7	11613305	11613305	1

Inversions: 12

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr9	763322	763487	LOC_Os09g02080
Inversion	Chr4	1394575	1644892	2
Inversion	Chr4	1478770	1644894	2
Inversion	Chr5	2906794	2906913	LOC_Os05g05810
Inversion	Chr1	14114853	14115026
Inversion	Chr1	16394795	16395086	LOC_Os01g29250
Inversion	Chr2	16794826	16794967
Inversion	Chr5	21354579	21442510	2
Inversion	Chr5	22608416	22608644
Inversion	Chr11	23548243	23548351
Inversion	Chr2	30499222	30499330
Inversion	Chr1	35722153	35722271	LOC_Os01g61760

Translocations: 9

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr11	539245	Chr7	23435000
Translocation	Chr7	1188874	Chr4	18475167
Translocation	Chr9	6529261	Chr3	19505903	2
Translocation	Chr9	6538778	Chr3	19505895	2
Translocation	Chr11	17701376	Chr8	24046280
Translocation	Chr6	17962566	Chr5	20198584	2
Translocation	Chr6	17962586	Chr5	20198851	LOC_Os06g30901
Translocation	Chr5	21442241	Chr1	3344165	LOC_Os05g36170
Translocation	Chr7	22919038	Chr5	14513378	2

Main menu