Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 39

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	2363063	A-G	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g05020
SBS	Chr1	2363064	G-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g05020
SBS	Chr1	8245731	G-A	HET
SBS	Chr1	16108178	G-A	HET
SBS	Chr1	16108179	T-A	HET
SBS	Chr1	16108180	T-A	HET
SBS	Chr1	28348035	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g49310
SBS	Chr1	33613506	G-A	Homo
SBS	Chr2	10865818	G-A	HET
SBS	Chr2	12067278	C-T	HET
SBS	Chr2	20954144	C-A	HET
SBS	Chr2	31384295	G-A	HET
SBS	Chr3	8453025	G-T	HET
SBS	Chr4	6849109	C-A	HET
SBS	Chr4	12072895	G-T	HET
SBS	Chr4	20955274	C-T	HET
SBS	Chr4	21955894	C-T	HET
SBS	Chr6	12940620	C-T	HET
SBS	Chr6	15295217	C-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g26140
SBS	Chr6	19479069	G-A	HET
SBS	Chr6	24211262	T-A	HET
SBS	Chr6	30472256	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g50340
SBS	Chr7	189798	A-T	HET
SBS	Chr7	9313383	A-T	Homo
SBS	Chr7	10602380	G-A	Homo
SBS	Chr7	14332901	T-C	Homo
SBS	Chr7	20965081	C-T	Homo
SBS	Chr7	24010192	C-T	Homo
SBS	Chr8	6696775	T-G	HET
SBS	Chr8	18623700	C-T	Homo
SBS	Chr8	22811119	C-T	HET
SBS	Chr9	3138373	G-T	HET
SBS	Chr10	7850412	T-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g15000
SBS	Chr10	15983886	A-T	HET
SBS	Chr11	3997915	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g07840
SBS	Chr12	4539511	G-C	HET
SBS	Chr12	8252055	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g14460
SBS	Chr12	10438821	C-T	HET
SBS	Chr12	12904832	C-T	HET

Deletions: 13

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr1	1581239	1581243	4
Deletion	Chr1	2156693	2156699	6
Deletion	Chr3	3583179	3583181	2
Deletion	Chr2	7470526	7470533	7
Deletion	Chr3	12312762	12312768	6
Deletion	Chr8	15416224	15416243	19
Deletion	Chr9	18319271	18319275	4
Deletion	Chr4	19804630	19804633	3
Deletion	Chr10	22815768	22815772	4
Deletion	Chr6	24434422	24434424	2
Deletion	Chr6	26643852	26643869	17
Deletion	Chr3	33498045	33498046	1	LOC_Os03g58820
Deletion	Chr1	38749750	38749751	1	LOC_Os01g66710

Insertions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr5	1996884	1996885	2
Insertion	Chr9	18835126	18835127	2

Inversions: 8

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr10	1921465	1921867	LOC_Os10g04140
Inversion	Chr10	2197725	2197945	LOC_Os10g04610
Inversion	Chr5	8272870	8272972
Inversion	Chr12	12187962	12188183
Inversion	Chr9	13572148	13572252	LOC_Os09g22500
Inversion	Chr8	22192887	22478054	2
Inversion	Chr1	32917375	32917526	LOC_Os01g56980
Inversion	Chr3	34441927	34442033	LOC_Os03g60610

Translocations: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr7	9666159	Chr4	14117298

Main menu