Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 58

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	9458496	G-A	HET
SBS	Chr1	16971299	C-T	HET
SBS	Chr2	4080938	A-G	HET
SBS	Chr2	18998797	A-G	HET
SBS	Chr2	20890380	T-A	HET
SBS	Chr2	25016812	C-T	HET
SBS	Chr2	25457436	C-T	HET	STOP_GAINED	LOC_Os02g42320
SBS	Chr2	35680051	T-G	HET
SBS	Chr3	3649499	T-G	HET
SBS	Chr3	7836730	G-T	Homo
SBS	Chr3	14143409	G-T	HET
SBS	Chr3	14621758	G-A	Homo
SBS	Chr3	16323612	T-C	HET
SBS	Chr3	25577455	C-T	Homo
SBS	Chr4	658333	G-T	Homo
SBS	Chr4	10456421	T-A	HET
SBS	Chr4	11417647	A-T	HET
SBS	Chr4	23917993	G-C	HET
SBS	Chr4	24364235	A-G	Homo
SBS	Chr4	26759781	G-T	HET
SBS	Chr5	204859	T-G	HET
SBS	Chr5	204860	A-C	HET
SBS	Chr5	1789209	A-G	HET
SBS	Chr5	7409407	C-G	HET
SBS	Chr5	21153665	C-A	HET
SBS	Chr5	27988691	T-C	HET
SBS	Chr6	1966137	A-C	HET
SBS	Chr6	2450247	T-A	HET
SBS	Chr6	2870086	C-G	HET
SBS	Chr6	4080333	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g08380
SBS	Chr6	13955945	C-A	HET
SBS	Chr6	14451054	C-A	HET
SBS	Chr7	9672407	C-T	HET
SBS	Chr7	19888397	T-C	HET
SBS	Chr7	24724135	C-T	HET
SBS	Chr7	27276651	G-A	HET
SBS	Chr8	1001878	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g02480
SBS	Chr8	1339993	G-A	HET
SBS	Chr8	2316747	C-T	HET
SBS	Chr8	15836700	T-A	HET
SBS	Chr8	15836701	A-T	HET
SBS	Chr8	16743012	T-A	HET
SBS	Chr8	18296314	G-C	HET
SBS	Chr8	19854187	G-A	HET
SBS	Chr8	21081133	C-A	HET
SBS	Chr8	24155265	G-C	HET
SBS	Chr8	25297200	G-A	HET
SBS	Chr9	13100250	C-A	HET
SBS	Chr11	136163	G-T	HET
SBS	Chr11	3158507	G-T	HET
SBS	Chr11	5579424	C-T	HET
SBS	Chr11	5673923	C-G	HET
SBS	Chr12	3270478	G-A	HET
SBS	Chr12	9091319	C-T	HET
SBS	Chr12	9864108	C-A	Homo
SBS	Chr12	11532101	T-C	HET
SBS	Chr12	15387456	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g26340
SBS	Chr12	24345998	C-T	HET

Deletions: 12

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	373909	373920	11
Deletion	Chr4	1338757	1338758	1
Deletion	Chr6	1435673	1435675	2
Deletion	Chr2	6539536	6539543	7
Deletion	Chr2	14665001	14692000	26999	3
Deletion	Chr3	15868680	15868682	2
Deletion	Chr12	19397704	19397710	6
Deletion	Chr2	20343047	20343057	10
Deletion	Chr6	26839833	26839837	4
Deletion	Chr4	27009252	27009259	7
Deletion	Chr3	31295543	31295547	4	LOC_Os03g55030
Deletion	Chr1	42837932	42837934	2

Insertions: 4

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr2	2106504	2106505	2
Insertion	Chr2	35513034	35513035	2
Insertion	Chr9	10081501	10081502	2
Insertion	Chr5	8820771	8820771	1

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr8	20638963	20755154
Inversion	Chr8	20638988	20755162
Inversion	Chr12	21050416	21093754	2

Translocations: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr12	8862088	Chr8	16078130
Translocation	Chr11	28696498	Chr3	19693471	2

Main menu