Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 43

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	2006055	G-A	HET
SBS	Chr1	13640158	C-G	HET
SBS	Chr1	15179112	G-A	HET
SBS	Chr1	19167117	A-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g34750
SBS	Chr2	4668547	T-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g09100
SBS	Chr2	27670386	C-A	HET
SBS	Chr2	30580985	T-C	HET
SBS	Chr2	34535995	T-A	HET
SBS	Chr3	5015514	C-A	HET
SBS	Chr3	11368991	C-A	HET
SBS	Chr3	32492419	C-T	HET
SBS	Chr4	8025600	C-T	Homo
SBS	Chr4	9613778	T-C	Homo
SBS	Chr4	24360819	T-A	Homo
SBS	Chr4	28275277	G-A	HET
SBS	Chr4	29574145	G-A	HET
SBS	Chr5	7474094	A-G	HET
SBS	Chr5	14462885	C-A	HET
SBS	Chr5	17712755	G-A	Homo
SBS	Chr6	10142799	A-G	HET
SBS	Chr6	17069743	C-A	HET
SBS	Chr6	29791779	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g49170
SBS	Chr7	10365152	G-A	HET
SBS	Chr7	12885531	C-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g22850
SBS	Chr7	18218638	G-A	HET
SBS	Chr7	21276374	T-A	HET
SBS	Chr8	12502422	C-A	HET
SBS	Chr8	14570311	A-T	HET
SBS	Chr8	16067265	C-T	HET
SBS	Chr9	1843646	C-A	HET
SBS	Chr9	5763218	T-C	Homo
SBS	Chr9	9311102	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g15270
SBS	Chr9	11887897	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g19860
SBS	Chr10	2242239	T-C	HET
SBS	Chr10	9176857	T-C	Homo
SBS	Chr10	18010346	A-C	HET
SBS	Chr11	10878746	A-G	Homo
SBS	Chr11	28185076	G-A	HET
SBS	Chr12	6628036	G-A	HET
SBS	Chr12	6628037	G-A	HET
SBS	Chr12	17851542	G-A	HET
SBS	Chr12	24209542	C-T	HET
SBS	Chr12	24655014	G-A	HET

Deletions: 17

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	729375	729378	3
Deletion	Chr7	922136	922140	4
Deletion	Chr9	929454	929458	4
Deletion	Chr3	1061001	1075000	13999
Deletion	Chr12	5557948	5557952	4
Deletion	Chr5	9096649	9096652	3
Deletion	Chr3	9725770	9725780	10	LOC_Os03g17500
Deletion	Chr10	11183258	11183259	1
Deletion	Chr5	11787888	11787901	13
Deletion	Chr6	12760552	12760561	9	LOC_Os06g22030
Deletion	Chr10	13292366	13292367	1
Deletion	Chr10	14295083	14295084	1
Deletion	Chr11	14785219	14785237	18
Deletion	Chr4	16293182	16293183	1
Deletion	Chr7	22457712	22457715	3	LOC_Os07g37510
Deletion	Chr5	23138898	23138918	20
Deletion	Chr2	23911677	23911680	3	LOC_Os02g39630

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr1	10488505	10488505	1
Insertion	Chr3	31944884	31944889	6
Insertion	Chr12	15707385	15707385	1

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr9	1532672	1784850	2
Inversion	Chr12	11799170	11908223	LOC_Os12g20230
Inversion	Chr12	11799178	11908225	LOC_Os12g20230

Translocations: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr9	5190821	Chr6	8717561
Translocation	Chr10	10693729	Chr2	17722963	2
Translocation	Chr10	10694161	Chr2	17722965	2
Translocation	Chr9	18078406	Chr8	13991722	LOC_Os09g29730
Translocation	Chr11	22571973	Chr7	4765537	LOC_Os11g38050

Main menu