Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 58

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3547624	A-G	HET
SBS	Chr1	8199910	C-T	HET
SBS	Chr1	9346232	G-A	HET
SBS	Chr1	9505101	A-G	HET
SBS	Chr1	16565408	T-G	Homo
SBS	Chr1	18019721	G-A	HET
SBS	Chr1	27670077	T-A	Homo
SBS	Chr1	30842663	C-G	Homo
SBS	Chr1	37046767	G-A	HET
SBS	Chr1	43057609	A-T	HET
SBS	Chr2	2082331	G-A	HET
SBS	Chr2	2124220	A-G	HET
SBS	Chr2	8798496	T-C	Homo
SBS	Chr2	10880102	G-T	Homo
SBS	Chr2	14400716	A-T	HET
SBS	Chr2	14400739	A-G	HET
SBS	Chr2	14408534	T-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g24860
SBS	Chr2	14467080	T-A	HET	STOP_GAINED	LOC_Os02g24950
SBS	Chr2	17231973	G-A	HET
SBS	Chr2	22810607	G-A	Homo
SBS	Chr2	27890958	G-T	HET
SBS	Chr2	35533033	G-T	HET
SBS	Chr3	11154091	C-A	HET
SBS	Chr3	17178680	G-A	HET
SBS	Chr3	19407007	G-A	HET
SBS	Chr3	23342570	C-T	Homo
SBS	Chr3	23750183	C-A	Homo
SBS	Chr3	35544934	T-A	HET
SBS	Chr4	8276191	G-A	HET
SBS	Chr4	16174321	A-G	HET
SBS	Chr4	23781948	C-T	HET
SBS	Chr5	8103257	C-A	HET
SBS	Chr5	8518069	T-G	HET
SBS	Chr5	17807760	G-T	HET
SBS	Chr5	22621524	C-T	HET
SBS	Chr7	12400244	G-A	Homo
SBS	Chr7	25489346	G-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g42590
SBS	Chr8	1812306	G-A	HET
SBS	Chr8	8551709	G-A	HET
SBS	Chr9	4633442	A-G	HET
SBS	Chr9	18647927	C-T	HET
SBS	Chr10	5155337	T-C	Homo
SBS	Chr10	21812253	C-T	HET
SBS	Chr10	22074950	T-G	Homo
SBS	Chr10	22078664	C-T	HET
SBS	Chr11	3851324	T-C	HET
SBS	Chr11	4286116	T-C	HET
SBS	Chr11	6960635	C-T	HET
SBS	Chr11	17891740	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g30720
SBS	Chr11	27106521	C-A	HET
SBS	Chr12	4740550	C-T	HET
SBS	Chr12	9129213	C-T	HET
SBS	Chr12	15083607	G-A	HET
SBS	Chr12	15083608	C-A	HET
SBS	Chr12	15586441	C-G	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g26620
SBS	Chr12	16054722	G-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g27330
SBS	Chr12	24272675	C-T	HET
SBS	Chr12	24592339	C-T	HET

Deletions: 25

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr2	2158001	2200000	41999	6
Deletion	Chr4	3550049	3550061	12
Deletion	Chr10	5348997	5349007	10
Deletion	Chr5	6981773	6981775	2
Deletion	Chr6	8479240	8479241	1
Deletion	Chr12	9003502	9003522	20
Deletion	Chr10	9567287	9567288	1
Deletion	Chr6	10428913	10429013	100
Deletion	Chr1	10970963	10970965	2
Deletion	Chr2	11090905	11090914	9
Deletion	Chr6	12087683	12087684	1
Deletion	Chr10	12668053	12668061	8
Deletion	Chr2	13745225	13745236	11
Deletion	Chr9	13984592	13984599	7
Deletion	Chr1	15181772	15181775	3
Deletion	Chr1	19109652	19109653	1
Deletion	Chr12	19655723	19655731	8
Deletion	Chr6	20094842	20094844	2	LOC_Os06g34550
Deletion	Chr3	23543553	23543560	7
Deletion	Chr11	27007769	27007772	3	LOC_Os11g44660
Deletion	Chr8	27457507	27457520	13
Deletion	Chr6	28766425	28766453	28
Deletion	Chr1	30842894	30842898	4
Deletion	Chr4	35280525	35280530	5
Deletion	Chr1	37671285	37671295	10

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr2	32845837	32845838	2
Insertion	Chr6	8123250	8123251	2
Insertion	Chr2	9395950	9395950	1

Inversions: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr1	4571632	4893119	2
Inversion	Chr1	4571659	4893153	2
Inversion	Chr1	8207829	8962770	2
Inversion	Chr6	11594821	12541706	LOC_Os06g20210

Translocations: 11

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr10	924026	Chr4	20857478	2
Translocation	Chr10	924027	Chr4	20858572	LOC_Os10g02490
Translocation	Chr8	11501495	Chr1	10187287	2
Translocation	Chr6	12541723	Chr1	8207861
Translocation	Chr6	14285741	Chr2	17279310	2
Translocation	Chr6	14285763	Chr2	17279598	2
Translocation	Chr11	15249062	Chr1	11769608
Translocation	Chr11	15372669	Chr9	7355986	LOC_Os11g26810
Translocation	Chr11	15372967	Chr9	7364785	LOC_Os11g26810
Translocation	Chr12	18686678	Chr5	13636098
Translocation	Chr11	22131611	Chr6	12651485	2

Main menu