Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 50

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	10818765	T-A	HET
SBS	Chr1	20870488	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g37380
SBS	Chr1	23847275	A-T	HET
SBS	Chr1	41094868	C-T	HET
SBS	Chr2	1730471	G-A	HET
SBS	Chr2	1730472	T-A	HET
SBS	Chr2	2557273	A-T	HET
SBS	Chr2	8717488	G-A	HET
SBS	Chr2	11127627	C-G	HET
SBS	Chr2	16041095	C-T	HET
SBS	Chr2	27090682	A-T	Homo
SBS	Chr2	33242773	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g54220
SBS	Chr3	3942869	C-T	HET
SBS	Chr3	24742001	C-T	Homo
SBS	Chr3	26919813	A-T	Homo
SBS	Chr3	26919982	G-C	Homo
SBS	Chr3	31664304	C-T	HET
SBS	Chr3	33299894	G-T	HET
SBS	Chr4	26910382	G-A	HET
SBS	Chr4	31823365	A-G	Homo
SBS	Chr5	5477668	C-T	HET
SBS	Chr5	21974431	G-A	HET
SBS	Chr5	29376754	C-A	HET
SBS	Chr5	29407442	A-T	HET
SBS	Chr6	1370049	C-A	HET
SBS	Chr6	6129893	C-T	Homo
SBS	Chr6	12677145	G-A	HET
SBS	Chr6	13847960	C-T	HET
SBS	Chr7	11512040	T-C	HET
SBS	Chr7	11764736	C-T	HET
SBS	Chr7	24000935	T-A	HET
SBS	Chr7	24647951	G-A	Homo
SBS	Chr7	26984505	G-C	HET
SBS	Chr8	645050	T-C	Homo
SBS	Chr8	8933691	A-G	HET
SBS	Chr8	10874725	A-G	HET
SBS	Chr8	16191740	C-A	Homo
SBS	Chr8	22414679	G-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g35590
SBS	Chr9	245707	A-C	HET
SBS	Chr9	14461201	T-C	HET
SBS	Chr9	17249526	C-T	Homo
SBS	Chr10	10512359	T-C	HET
SBS	Chr11	19336340	A-G	HET
SBS	Chr11	20286455	T-A	HET
SBS	Chr11	20286459	G-A	HET
SBS	Chr12	6635269	G-A	HET
SBS	Chr12	8462363	T-G	HET
SBS	Chr12	16490991	G-T	HET
SBS	Chr12	22747710	T-C	Homo
SBS	Chr12	25697363	C-T	HET

Deletions: 19

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr12	748521	748523	2
Deletion	Chr1	2507302	2507304	2	LOC_Os01g05320
Deletion	Chr10	3018001	3070000	51999	6
Deletion	Chr10	8893847	8893848	1
Deletion	Chr1	9499001	9510000	10999	2
Deletion	Chr11	9948382	9948384	2
Deletion	Chr8	10764306	10764307	1
Deletion	Chr3	11887376	11887378	2	LOC_Os03g20949
Deletion	Chr4	12767630	12767633	3
Deletion	Chr6	13000040	13000043	3
Deletion	Chr12	15675036	15675038	2	LOC_Os12g26750
Deletion	Chr1	16690681	16690688	7
Deletion	Chr6	19837111	19837112	1
Deletion	Chr7	20221814	20221825	11	LOC_Os07g33790
Deletion	Chr5	20460357	20460359	2
Deletion	Chr8	22621645	22621646	1
Deletion	Chr3	26634531	26634535	4
Deletion	Chr7	28968946	28968958	12
Deletion	Chr4	31823679	31823696	17

Insertions: 1

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr5	15117169	15117169	1

Inversions: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr9	1886909	2021065	2
Inversion	Chr4	17906696	18052674	LOC_Os04g30010
Inversion	Chr7	23747759	23749803	LOC_Os07g39620
Inversion	Chr7	23747765	23749803	LOC_Os07g39620

Translocations: 10

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr11	988556	Chr8	17926995	2
Translocation	Chr9	1983159	Chr7	18792322
Translocation	Chr9	1983337	Chr7	18792329
Translocation	Chr7	3981710	Chr3	2616129	2
Translocation	Chr4	7546308	Chr1	2551472	2
Translocation	Chr6	9794993	Chr4	17545681	2
Translocation	Chr7	11638243	Chr6	15056095	2
Translocation	Chr12	14994702	Chr4	8795685	2
Translocation	Chr10	22576955	Chr2	26313310	2
Translocation	Chr6	23392552	Chr2	20261348

Main menu