Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 40

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	19982389	T-C	HET
SBS	Chr1	38329087	T-A	HET
SBS	Chr2	20017290	G-T	HET
SBS	Chr2	31223349	G-A	HET
SBS	Chr2	35011523	A-G	Homo
SBS	Chr3	6758315	G-A	HET
SBS	Chr3	9693514	C-T	Homo
SBS	Chr3	24991745	A-G	HET
SBS	Chr3	26074698	A-C	Homo
SBS	Chr3	30163390	G-A	HET
SBS	Chr4	8402055	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g14940
SBS	Chr4	8812249	G-A	HET
SBS	Chr5	524062	G-C	HET
SBS	Chr5	5686918	G-A	HET
SBS	Chr5	25335409	G-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g43570
SBS	Chr6	22165436	C-T	HET
SBS	Chr7	485240	G-A	HET
SBS	Chr7	21078074	G-A	HET
SBS	Chr7	23617452	C-T	HET
SBS	Chr8	21195051	G-A	Homo
SBS	Chr8	21195053	G-A	Homo
SBS	Chr8	21257219	T-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g33950
SBS	Chr9	5770263	C-A	HET
SBS	Chr9	11546082	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g19290
SBS	Chr9	21254558	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g36860
SBS	Chr9	21254559	G-A	HET
SBS	Chr9	22076790	C-G	HET
SBS	Chr10	268031	T-A	Homo
SBS	Chr11	4450055	G-A	HET
SBS	Chr11	8964784	C-A	HET
SBS	Chr11	12001334	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g20720
SBS	Chr11	13595362	C-T	HET
SBS	Chr11	13595363	C-T	HET
SBS	Chr11	13807445	A-G	HET
SBS	Chr11	14463859	T-C	HET
SBS	Chr11	20621523	A-G	HET
SBS	Chr12	9041685	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g15860
SBS	Chr12	11613192	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g19930
SBS	Chr12	17049208	A-C	HET
SBS	Chr12	19309042	C-T	HET

Deletions: 16

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr6	3089458	3089472	14
Deletion	Chr7	3713278	3713279	1
Deletion	Chr12	4055986	4055992	6
Deletion	Chr2	7509736	7509761	25	LOC_Os02g13850
Deletion	Chr7	9612033	9612049	16
Deletion	Chr12	11557621	11557638	17
Deletion	Chr9	12626465	12626467	2
Deletion	Chr9	14670798	14670799	1
Deletion	Chr1	16534207	16534208	1
Deletion	Chr12	19189001	19290000	100999	12
Deletion	Chr3	19235232	19235233	1
Deletion	Chr2	19685614	19685617	3
Deletion	Chr4	30479024	30479027	3
Deletion	Chr2	34463476	34463483	7	LOC_Os02g56300
Deletion	Chr3	35708142	35708146	4
Deletion	Chr1	38643818	38643819	1

Insertions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr5	29103569	29103570	2
Insertion	Chr10	17998445	17998470	26

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr5	3190947	3969039	LOC_Os05g06270
Inversion	Chr5	3190954	3969053	LOC_Os05g06270
Inversion	Chr3	18032367	18073228	2

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr3	4835539	Chr2	31057052	2
Translocation	Chr9	7135536	Chr6	11646403	LOC_Os09g12480
Translocation	Chr3	13539829	Chr2	30014446	2
Translocation	Chr11	26925402	Chr8	1219433	2

Main menu