Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 51

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	10545776	C-T	HET
SBS	Chr1	19027873	G-A	HET
SBS	Chr1	19737218	T-C	HET
SBS	Chr1	29329544	T-C	HET
SBS	Chr1	32063713	T-A	Homo
SBS	Chr2	8355350	G-A	HET
SBS	Chr2	18885656	G-A	Homo
SBS	Chr2	20793274	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g34660
SBS	Chr2	20793276	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g34660
SBS	Chr3	4186401	G-A	HET
SBS	Chr3	13326217	C-A	Homo
SBS	Chr3	16034727	T-C	HET
SBS	Chr3	16849124	G-T	HET
SBS	Chr3	18854188	G-A	HET
SBS	Chr3	23835002	A-G	HET
SBS	Chr3	28369561	C-T	HET
SBS	Chr4	7420905	C-T	Homo
SBS	Chr4	12638042	T-A	Homo
SBS	Chr4	19428291	C-G	Homo
SBS	Chr5	14062997	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g24300
SBS	Chr5	16823315	C-T	HET
SBS	Chr5	24963282	T-C	HET
SBS	Chr5	24963283	A-T	HET
SBS	Chr5	26074346	G-A	HET
SBS	Chr7	4210481	C-T	HET
SBS	Chr7	8139444	T-C	HET
SBS	Chr7	10608441	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g17930
SBS	Chr7	18909743	C-A	HET
SBS	Chr8	12696462	T-C	Homo
SBS	Chr8	14518896	G-T	HET
SBS	Chr8	19492637	C-T	HET
SBS	Chr8	20626123	T-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g33160
SBS	Chr8	22564733	G-T	HET
SBS	Chr8	25750222	T-C	HET
SBS	Chr8	26581080	G-A	HET
SBS	Chr9	6591940	G-A	Homo
SBS	Chr9	6591942	A-T	Homo
SBS	Chr9	8767262	C-A	HET
SBS	Chr9	11260000	T-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g18360
SBS	Chr9	11260005	C-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g18360
SBS	Chr9	14621063	G-A	Homo
SBS	Chr10	8726525	C-T	HET
SBS	Chr10	15545024	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g29940
SBS	Chr11	21798356	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g36950
SBS	Chr11	24774111	C-T	HET
SBS	Chr11	25028374	G-T	HET
SBS	Chr12	248452	G-A	HET
SBS	Chr12	10915341	G-A	HET
SBS	Chr12	14430760	G-A	HET
SBS	Chr12	14948404	G-A	HET
SBS	Chr12	15043437	C-G	HET

Deletions: 12

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	562189	562193	4
Deletion	Chr2	2491818	2491823	5
Deletion	Chr10	3606127	3606134	7
Deletion	Chr10	9215489	9215496	7
Deletion	Chr2	20406461	20406484	23
Deletion	Chr11	21373524	21373527	3
Deletion	Chr12	26393472	26393473	1
Deletion	Chr4	26431561	26431563	2
Deletion	Chr3	26676711	26676713	2
Deletion	Chr1	30256001	30350000	93999	12
Deletion	Chr1	32144971	32144972	1
Deletion	Chr3	35090458	35090461	3

Insertions: 5

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr6	3255931	3255932	2
Insertion	Chr8	28224105	28224106	2
Insertion	Chr4	2102917	2102918	2
Insertion	Chr4	14979680	14979681	2
Insertion	Chr6	16630623	16630623	1	LOC_Os06g29140

No Inversion

Translocations: 13

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr10	2491072	Chr5	25142917
Translocation	Chr10	3669339	Chr4	33407149
Translocation	Chr8	4306960	Chr6	25086676
Translocation	Chr7	10136799	Chr2	30553950	LOC_Os07g17210
Translocation	Chr7	10140869	Chr2	30553874
Translocation	Chr11	12007501	Chr4	6643298
Translocation	Chr7	12886311	Chr5	2320280
Translocation	Chr8	13069649	Chr2	9805464
Translocation	Chr10	16821028	Chr1	41587176
Translocation	Chr12	18408964	Chr4	35415968	2
Translocation	Chr5	18822687	Chr2	29161329	2
Translocation	Chr8	20440108	Chr5	6354833
Translocation	Chr7	23842203	Chr1	39419953

Main menu