Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 48

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	10717133	G-A	Homo
SBS	Chr1	19064834	G-C	Homo
SBS	Chr1	23874063	G-C	HET
SBS	Chr1	31494648	A-G	HET
SBS	Chr1	37141112	G-A	HET
SBS	Chr2	5039571	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g09770
SBS	Chr2	20693497	C-T	HET
SBS	Chr2	30280077	G-A	HET
SBS	Chr2	33005487	G-T	HET
SBS	Chr3	578272	C-T	HET
SBS	Chr3	1028132	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g02740
SBS	Chr3	1028134	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g02740
SBS	Chr3	1370759	A-G	HET
SBS	Chr3	6204365	C-A	HET
SBS	Chr3	20193367	G-C	HET
SBS	Chr3	30811549	C-T	HET
SBS	Chr4	6785098	T-C	HET
SBS	Chr4	11606622	T-G	HET
SBS	Chr5	1103642	C-A	HET
SBS	Chr5	4790209	C-A	Homo
SBS	Chr5	4790210	T-A	Homo
SBS	Chr5	8384647	T-C	HET
SBS	Chr5	20555523	G-A	HET
SBS	Chr6	7241299	C-G	HET
SBS	Chr6	10608249	T-C	HET
SBS	Chr6	10875450	G-T	HET
SBS	Chr6	15332638	G-A	HET
SBS	Chr6	26208658	G-A	HET
SBS	Chr7	13422	C-T	Homo
SBS	Chr7	1907928	C-T	Homo
SBS	Chr7	5927626	G-A	HET
SBS	Chr7	11615288	C-A	HET
SBS	Chr7	14785712	G-A	HET
SBS	Chr7	19577697	C-T	HET
SBS	Chr7	29446683	A-T	HET
SBS	Chr8	16839010	G-T	HET
SBS	Chr8	21590989	A-T	Homo
SBS	Chr9	437128	C-G	HET
SBS	Chr9	10089691	A-G	HET
SBS	Chr10	7887128	G-A	HET
SBS	Chr11	14481018	C-T	Homo
SBS	Chr11	16380880	A-C	HET
SBS	Chr11	18015074	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g30960
SBS	Chr11	26961797	G-T	HET
SBS	Chr12	6957888	A-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g12630
SBS	Chr12	13612412	C-T	Homo
SBS	Chr12	18169259	G-A	HET
SBS	Chr12	20723950	A-G	HET

Deletions: 10

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr10	1040001	1040002	1
Deletion	Chr10	1142246	1142250	4
Deletion	Chr2	1519006	1519018	12
Deletion	Chr12	2295784	2295790	6
Deletion	Chr1	5233450	5233457	7
Deletion	Chr4	13020451	13020459	8
Deletion	Chr11	17597095	17597099	4
Deletion	Chr1	20070174	20070178	4	LOC_Os01g36250
Deletion	Chr1	22283349	22283359	10
Deletion	Chr8	23813721	23813722	1

Insertions: 4

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr2	34845898	34845899	2
Insertion	Chr5	15148791	15148792	2
Insertion	Chr8	24553184	24553192	9
Insertion	Chr2	15513158	15513168	11

Inversions: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr4	19563277	19563455

Translocations: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr12	7396065	Chr7	27949360	2
Translocation	Chr4	17332224	Chr3	16471233	LOC_Os04g29224

Main menu