Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 42

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	972442	A-G	HET
SBS	Chr1	28566540	A-T	Homo
SBS	Chr1	40685653	T-A	Homo
SBS	Chr2	1919284	C-T	HET
SBS	Chr2	3021181	A-T	HET
SBS	Chr2	6661738	T-C	HET
SBS	Chr2	9506154	C-T	HET
SBS	Chr2	14420186	T-C	HET
SBS	Chr3	14644109	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g25590
SBS	Chr3	23303977	T-C	HET
SBS	Chr3	33760213	G-A	Homo
SBS	Chr3	34559932	T-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g60820
SBS	Chr4	1538725	C-T	HET
SBS	Chr4	4084155	G-T	HET
SBS	Chr4	10792584	C-T	HET
SBS	Chr4	11183593	A-T	HET
SBS	Chr4	13007908	T-A	HET
SBS	Chr4	23060186	C-A	Homo
SBS	Chr6	8092898	A-G	HET
SBS	Chr6	8354613	A-G	HET
SBS	Chr6	11367176	G-C	HET
SBS	Chr6	13036320	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g22430
SBS	Chr6	17655491	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g30520
SBS	Chr6	22849119	A-G	HET
SBS	Chr7	8432360	C-T	HET
SBS	Chr7	14026266	C-T	HET
SBS	Chr8	11012988	C-T	HET
SBS	Chr8	17044124	G-A	HET
SBS	Chr9	4372030	A-T	Homo
SBS	Chr9	8397356	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g14200
SBS	Chr9	17512984	A-G	HET
SBS	Chr10	5486005	T-A	HET
SBS	Chr10	7632178	A-T	HET
SBS	Chr10	11363731	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g22010
SBS	Chr10	18131994	T-C	HET
SBS	Chr11	5302271	C-T	HET
SBS	Chr11	11292831	G-A	HET
SBS	Chr11	13110784	C-T	HET
SBS	Chr11	17003561	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g29320
SBS	Chr12	8954890	G-T	Homo
SBS	Chr12	21310611	C-A	HET
SBS	Chr12	26080476	A-G	HET

Deletions: 9

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr12	1939576	1939577	1
Deletion	Chr9	3409287	3409289	2
Deletion	Chr1	4187174	4187175	1
Deletion	Chr3	9224383	9224397	14
Deletion	Chr11	17016308	17016309	1
Deletion	Chr11	19957717	19957719	2
Deletion	Chr3	21776121	21776124	3	LOC_Os03g39210
Deletion	Chr11	22392417	22392418	1
Deletion	Chr1	42889149	42889163	14

Insertions: 12

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr5	2567681	2567682	2
Insertion	Chr11	21702208	21702211	4
Insertion	Chr3	16685616	16685616	1
Insertion	Chr4	2359340	2359341	2
Insertion	Chr5	500547	500548	2
Insertion	Chr6	5487850	5487857	8
Insertion	Chr7	9547238	9547238	1
Insertion	Chr8	5022341	5022343	3
Insertion	Chr8	17063302	17063302	1
Insertion	Chr8	18376583	18376584	2
Insertion	Chr11	17989059	17989059	1
Insertion	Chr12	19010696	19010699	4

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr3	26826304	26834118
Inversion	Chr3	26826334	26834120

Translocations: 8

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr6	630625	Chr5	25587964	LOC_Os06g02120
Translocation	Chr9	5556216	Chr7	9565144	2
Translocation	Chr7	8834475	Chr5	10239419
Translocation	Chr6	11805400	Chr5	8992680	2
Translocation	Chr8	12904520	Chr1	19915912
Translocation	Chr12	15481492	Chr8	5914750
Translocation	Chr11	20125959	Chr3	8265561	2
Translocation	Chr7	27954782	Chr3	9959771	LOC_Os07g46780

Main menu