Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 59

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	10663293	G-A	HET
SBS	Chr1	17114564	T-C	HET
SBS	Chr1	25691992	A-G	HET
SBS	Chr1	32743063	C-T	HET
SBS	Chr1	43024685	A-T	Homo
SBS	Chr2	3971653	G-T	Homo
SBS	Chr2	18024864	C-T	HET
SBS	Chr2	28182669	C-G	Homo
SBS	Chr3	8191580	C-T	HET
SBS	Chr3	21552725	C-T	HET
SBS	Chr3	25214290	G-C	HET
SBS	Chr3	28274552	C-T	HET
SBS	Chr3	31781774	C-T	HET
SBS	Chr3	33403682	T-C	HET
SBS	Chr3	34238255	A-C	HET
SBS	Chr4	1944	G-A	HET
SBS	Chr4	5671278	T-C	HET
SBS	Chr4	6110329	C-T	HET
SBS	Chr4	13651939	T-A	HET
SBS	Chr4	16935597	C-T	HET
SBS	Chr4	17059809	G-T	HET
SBS	Chr5	3519287	A-G	HET
SBS	Chr5	5935632	A-G	HET
SBS	Chr5	16375153	G-C	HET
SBS	Chr5	19604125	T-C	HET
SBS	Chr5	21652238	T-C	HET
SBS	Chr6	2998472	C-T	HET
SBS	Chr6	5281039	A-T	HET
SBS	Chr6	19732995	T-A	HET
SBS	Chr7	7899148	C-T	Homo
SBS	Chr7	8142501	G-T	HET
SBS	Chr7	11327689	T-A	HET
SBS	Chr7	24274756	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g40520
SBS	Chr8	9064835	A-G	HET
SBS	Chr8	9872965	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g16190
SBS	Chr8	17085853	G-A	HET
SBS	Chr8	17924788	G-T	HET
SBS	Chr8	27187672	G-A	HET
SBS	Chr9	2647204	A-G	Homo
SBS	Chr9	4502118	T-C	HET
SBS	Chr9	4533826	A-G	HET
SBS	Chr9	12661658	T-A	HET
SBS	Chr9	15101564	G-C	HET
SBS	Chr10	4369908	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g08060
SBS	Chr10	7670399	C-G	HET
SBS	Chr10	8545410	G-A	HET
SBS	Chr10	18967816	C-T	HET
SBS	Chr11	2293021	T-A	Homo
SBS	Chr11	3272416	A-G	HET
SBS	Chr11	3654451	A-G	Homo
SBS	Chr11	9383139	A-C	HET
SBS	Chr11	20444813	G-A	HET
SBS	Chr11	21800632	C-T	HET
SBS	Chr11	23201344	A-T	Homo
SBS	Chr11	23201345	A-T	Homo
SBS	Chr12	4277653	G-A	HET
SBS	Chr12	10792621	A-T	HET
SBS	Chr12	12474125	G-A	HET
SBS	Chr12	17032986	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g28810

Deletions: 16

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr10	528110	528111	1
Deletion	Chr8	1629903	1629912	9	LOC_Os08g03470
Deletion	Chr2	3639734	3639736	2
Deletion	Chr6	4825115	4825144	29
Deletion	Chr12	4944042	4944043	1
Deletion	Chr3	7946801	7946809	8	LOC_Os03g14630
Deletion	Chr3	10812107	10812110	3
Deletion	Chr4	11464513	11464516	3
Deletion	Chr8	12438142	12438158	16
Deletion	Chr3	13106943	13107034	91
Deletion	Chr11	15245050	15245051	1
Deletion	Chr12	15532350	15532351	1
Deletion	Chr10	21113373	21113376	3	LOC_Os10g39520
Deletion	Chr11	28345609	28345613	4
Deletion	Chr7	29530802	29530820	18
Deletion	Chr4	29597604	29597605	1

Insertions: 8

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr2	1587011	1587012	2
Insertion	Chr5	2468330	2468331	2
Insertion	Chr5	29017211	29017212	2
Insertion	Chr7	14959981	14959983	3
Insertion	Chr7	19605296	19605297	2
Insertion	Chr9	3199189	3199192	4
Insertion	Chr6	31526	31527	2
Insertion	Chr12	18817390	18817390	1

Inversions: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr11	3629814	3656456	LOC_Os11g07225
Inversion	Chr11	3629818	3656463	LOC_Os11g07225
Inversion	Chr10	5787856	6277082	LOC_Os10g10500
Inversion	Chr5	17680571	17680691	LOC_Os05g30510

Translocations: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr12	6015144	Chr8	7185780
Translocation	Chr9	16167556	Chr6	4276880	2
Translocation	Chr6	22695339	Chr4	27385193
Translocation	Chr4	22819421	Chr3	24030531	2
Translocation	Chr11	28275633	Chr4	22819310

Main menu