Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 26

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	24401002	C-T	Homo
SBS	Chr2	6795589	G-T	HET
SBS	Chr2	20656794	G-A	HET
SBS	Chr2	20726151	G-A	HET
SBS	Chr2	29665678	A-T	HET
SBS	Chr2	30621811	T-C	HET
SBS	Chr3	9105098	G-A	HET
SBS	Chr3	10904147	A-T	Homo
SBS	Chr3	13638700	C-T	HET
SBS	Chr3	22809680	C-T	Homo
SBS	Chr4	4361560	T-A	Homo
SBS	Chr4	4434408	C-G	HET
SBS	Chr5	2390462	G-A	HET
SBS	Chr5	21200797	G-A	HET
SBS	Chr5	22629803	A-T	HET
SBS	Chr5	29612663	T-G	HET
SBS	Chr6	11387212	G-A	HET	STOP_GAINED	LOC_Os06g19900
SBS	Chr7	7020892	G-A	HET
SBS	Chr7	13710095	G-A	HET
SBS	Chr8	2250628	A-C	HET
SBS	Chr8	14229148	A-G	HET
SBS	Chr10	10100824	T-C	HET
SBS	Chr11	22432143	T-G	Homo
SBS	Chr11	26748815	G-A	HET
SBS	Chr12	2260705	G-A	HET
SBS	Chr12	3437933	G-A	HET

Deletions: 10

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr4	2213044	2213045	1
Deletion	Chr12	5178208	5178218	10
Deletion	Chr8	7527214	7527215	1	LOC_Os08g12700
Deletion	Chr4	8890817	8890821	4
Deletion	Chr1	14274602	14274606	4
Deletion	Chr8	19447718	19447720	2
Deletion	Chr9	21758041	21758059	18
Deletion	Chr8	21965089	21965092	3
Deletion	Chr10	22078864	22078870	6
Deletion	Chr1	38303588	38303591	3

Insertions: 4

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr1	17722031	17722031	1
Insertion	Chr4	703349	703372	24
Insertion	Chr7	1373823	1373823	1	LOC_Os07g03427
Insertion	Chr11	1947260	1947260	1

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr1	17004635	17019893
Inversion	Chr1	17004656	17019899

Translocations: 6

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr10	5720401	Chr2	24465250	2
Translocation	Chr8	5979870	Chr3	35071692
Translocation	Chr9	7010380	Chr3	21289190
Translocation	Chr9	7124547	Chr2	17732011
Translocation	Chr11	11831971	Chr7	14037580	2
Translocation	Chr12	26013520	Chr5	26614032

Main menu