Search Results

Mutant Information

Mutant Name	FN2765-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN2765-S Alignment File
Seed Availability	No
Mapping (Hover to Zoom-In)

Variant Information

Single base substitutions: 82

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	11922588	C-T	HET
SBS	Chr1	12893504	A-G	HET
SBS	Chr1	14016053	T-A	Homo
SBS	Chr1	19283800	T-C	HET
SBS	Chr1	25577722	G-T	HET
SBS	Chr1	29288572	A-T	HET
SBS	Chr1	31636038	T-G	HET
SBS	Chr1	36263939	A-G	HET
SBS	Chr1	40115858	C-T	HET
SBS	Chr2	224636	G-T	HET
SBS	Chr2	3948118	A-T	HET
SBS	Chr2	6747108	A-T	Homo
SBS	Chr2	16013916	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g27220
SBS	Chr2	17703887	C-A	HET
SBS	Chr3	350897	G-A	HET
SBS	Chr3	2746316	G-T	HET
SBS	Chr3	9303660	C-T	Homo
SBS	Chr3	18803329	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g32860
SBS	Chr3	19020070	C-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g33240
SBS	Chr3	31234634	C-T	Homo
SBS	Chr3	32387051	A-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g56840
SBS	Chr4	12765882	C-T	HET
SBS	Chr4	15044776	T-A	HET
SBS	Chr4	17307235	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g29190
SBS	Chr4	18404959	G-A	HET
SBS	Chr5	530908	T-A	HET
SBS	Chr5	743742	A-T	Homo
SBS	Chr5	6617047	C-A	HET
SBS	Chr5	10447889	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g18180
SBS	Chr5	12997757	G-A	HET
SBS	Chr5	16088682	G-A	HET
SBS	Chr5	21535003	G-T	Homo
SBS	Chr6	11941646	C-T	HET
SBS	Chr6	12039239	T-A	HET
SBS	Chr6	12805544	G-A	HET
SBS	Chr6	13005025	T-C	HET
SBS	Chr6	13596907	G-A	HET
SBS	Chr6	15301990	G-A	HET
SBS	Chr6	16137509	G-A	HET
SBS	Chr6	16836877	G-T	HET
SBS	Chr6	17192406	G-A	HET
SBS	Chr6	22233198	C-A	HET
SBS	Chr7	209962	G-T	HET
SBS	Chr7	8984277	C-T	HET
SBS	Chr7	9262232	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g15940
SBS	Chr7	14135240	G-T	HET
SBS	Chr7	16135349	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g27630
SBS	Chr7	21201885	G-C	HET
SBS	Chr8	6662149	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g11330
SBS	Chr8	9456123	T-C	HET
SBS	Chr8	9456156	G-T	HET
SBS	Chr8	18700711	T-G	Homo
SBS	Chr8	21153905	T-A	HET
SBS	Chr9	16051747	C-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g26550
SBS	Chr10	1852779	T-A	HET
SBS	Chr10	2289958	T-C	HET
SBS	Chr10	9193666	G-A	HET
SBS	Chr10	9823601	G-T	HET
SBS	Chr10	19318754	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g36140
SBS	Chr11	975856	C-T	HET
SBS	Chr11	2740387	C-T	HET
SBS	Chr11	7969526	G-A	HET
SBS	Chr11	8242108	C-A	HET
SBS	Chr11	9258824	G-T	HET
SBS	Chr11	11199616	C-T	HET
SBS	Chr11	13850170	C-A	Homo
SBS	Chr11	23816458	G-A	Homo
SBS	Chr11	26115239	T-C	HET
SBS	Chr11	26501494	A-G	HET
SBS	Chr12	322860	C-A	HET
SBS	Chr12	7670314	C-T	HET
SBS	Chr12	10594129	C-A	HET
SBS	Chr12	10908092	A-G	HET
SBS	Chr12	11210440	C-T	HET
SBS	Chr12	12659043	G-C	Homo
SBS	Chr12	12818534	C-A	HET
SBS	Chr12	13278861	T-A	HET
SBS	Chr12	13278862	G-T	HET
SBS	Chr12	14551657	T-A	Homo
SBS	Chr12	18063017	G-T	HET
SBS	Chr12	21871123	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g35890
SBS	Chr12	25259106	G-A	HET

Deletions: 16

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr8	911975	911976	1
Deletion	Chr12	2506649	2506650	1
Deletion	Chr7	2876231	2876252	21
Deletion	Chr2	3242883	3242886	3
Deletion	Chr5	5615782	5615788	6
Deletion	Chr7	7491001	7627000	135999	19
Deletion	Chr1	7910190	7910191	1
Deletion	Chr8	12169966	12169967	1
Deletion	Chr6	12630193	12630195	2
Deletion	Chr11	15501827	15501831	4
Deletion	Chr4	16011001	16020000	8999	3
Deletion	Chr4	16023001	16097000	73999	12
Deletion	Chr9	17406401	17406403	2
Deletion	Chr11	25027051	25027052	1
Deletion	Chr3	27491001	27501000	9999	LOC_Os03g48300
Deletion	Chr8	27908213	27908214	1

Insertions: 5

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr3	24182863	24182864	2
Insertion	Chr3	35010823	35010824	2
Insertion	Chr4	1615495	1615496	2
Insertion	Chr1	5943189	5943194	6
Insertion	Chr2	23336959	23336959	1

Inversions: 6

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr7	7264545	7288732
Inversion	Chr7	7418695	7624438	2
Inversion	Chr2	9998407	10100406
Inversion	Chr2	9998409	10100410
Inversion	Chr5	13603171	13846376	2
Inversion	Chr5	13603183	13846384	2

Translocations: 6

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr8	4116725	Chr5	24425573	2
Translocation	Chr8	4116952	Chr5	14470343
Translocation	Chr12	4332524	Chr1	25576631
Translocation	Chr5	14470339	Chr4	16004977	2
Translocation	Chr5	24425574	Chr4	16004977	2
Translocation	Chr12	27094165	Chr4	9895923	2

Main menu

You are here

Search Results