Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 49

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3970645	C-T	HET
SBS	Chr1	9667207	G-C	HET
SBS	Chr1	15479117	T-A	HET
SBS	Chr1	18385677	G-C	HET
SBS	Chr1	22914574	A-G	HET
SBS	Chr1	23145867	A-G	HET
SBS	Chr1	25919915	T-C	Homo
SBS	Chr1	26845503	A-G	HET
SBS	Chr1	32145202	G-T	HET
SBS	Chr1	33203158	C-A	HET
SBS	Chr1	43224110	G-A	HET
SBS	Chr2	3138527	A-C	HET
SBS	Chr2	13467174	C-T	HET
SBS	Chr2	22518269	C-A	HET
SBS	Chr2	22661459	A-G	HET
SBS	Chr2	27513727	C-T	HET
SBS	Chr3	22659617	A-T	HET
SBS	Chr3	26622174	C-G	HET
SBS	Chr4	8660568	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g15944
SBS	Chr4	20203451	G-A	HET
SBS	Chr4	27921301	C-T	HET
SBS	Chr4	34961422	T-C	HET
SBS	Chr5	442815	A-G	HET
SBS	Chr5	7317258	C-T	HET
SBS	Chr5	16108371	G-A	HET
SBS	Chr6	2047106	T-A	HET
SBS	Chr6	14218927	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g24310
SBS	Chr6	19922563	G-A	HET	STOP_GAINED	LOC_Os06g34200
SBS	Chr7	5876210	C-A	HET
SBS	Chr7	20738741	C-T	HET
SBS	Chr7	20738742	G-C	HET
SBS	Chr7	24198299	C-T	HET
SBS	Chr7	29223862	G-A	HET
SBS	Chr8	2245899	C-T	HET
SBS	Chr8	10356689	A-G	HET
SBS	Chr8	15785514	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g25950
SBS	Chr8	17609407	A-G	Homo
SBS	Chr8	24231227	T-A	HET
SBS	Chr8	25416729	T-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g40160
SBS	Chr9	984150	T-G	HET
SBS	Chr9	6794902	A-G	Homo
SBS	Chr9	11956712	A-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g19970
SBS	Chr9	20914093	G-A	HET
SBS	Chr10	13221130	A-T	HET
SBS	Chr11	2377333	C-T	HET
SBS	Chr11	23337947	C-T	HET
SBS	Chr12	1170486	T-A	Homo
SBS	Chr12	4505540	T-C	Homo
SBS	Chr12	26262664	T-G	Homo

Deletions: 23

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	297128	297133	5
Deletion	Chr3	1870183	1870187	4
Deletion	Chr1	4948602	4948612	10
Deletion	Chr5	6234669	6234670	1
Deletion	Chr6	7037612	7037622	10	LOC_Os06g12860
Deletion	Chr11	9819698	9819702	4
Deletion	Chr5	11093448	11093449	1
Deletion	Chr4	11327870	11327883	13
Deletion	Chr8	14278269	14278274	5
Deletion	Chr2	14401402	14401403	1
Deletion	Chr2	15424601	15424604	3
Deletion	Chr8	16933314	16933324	10	LOC_Os08g27800
Deletion	Chr12	17797001	17822000	24999	5
Deletion	Chr10	18203476	18203488	12	LOC_Os10g34110
Deletion	Chr12	19132399	19132403	4	LOC_Os12g31800
Deletion	Chr1	21553852	21553853	1
Deletion	Chr5	22432931	22432935	4	LOC_Os05g38260
Deletion	Chr3	22699170	22699171	1
Deletion	Chr11	23491836	23491837	1
Deletion	Chr11	27670024	27670027	3
Deletion	Chr2	28651359	28651369	10
Deletion	Chr11	28813990	28814003	13	LOC_Os11g47780
Deletion	Chr4	33485532	33485545	13

Insertions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr7	27866476	27866476	1
Insertion	Chr11	7302876	7302876	1	LOC_Os11g12870

No Inversion

Translocations: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr11	6230739	Chr10	7974725	LOC_Os11g11256
Translocation	Chr10	7227982	Chr4	22268572	2
Translocation	Chr10	7232478	Chr4	22268621	2
Translocation	Chr12	9907653	Chr10	7974751	LOC_Os12g17310
Translocation	Chr3	25863202	Chr2	16083922

Main menu