Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 55

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	19211660	G-A	HET
SBS	Chr1	33226513	A-G	HET
SBS	Chr2	2728742	G-A	Homo
SBS	Chr2	5879220	A-T	HET
SBS	Chr2	8753160	A-G	HET
SBS	Chr2	19133500	C-T	HET
SBS	Chr2	19501098	T-A	HET
SBS	Chr2	27693495	C-T	HET
SBS	Chr2	34414193	G-A	HET
SBS	Chr3	24289337	C-T	Homo
SBS	Chr3	29741813	T-A	HET
SBS	Chr3	30624822	G-A	HET
SBS	Chr3	33652190	C-T	HET
SBS	Chr4	2616579	G-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g05250
SBS	Chr4	8897770	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g16370
SBS	Chr4	10882644	G-T	Homo
SBS	Chr4	14203140	A-G	Homo
SBS	Chr4	14592160	G-T	Homo
SBS	Chr4	25056418	C-T	HET
SBS	Chr4	25365810	C-T	HET
SBS	Chr4	31585635	T-A	HET
SBS	Chr5	4494616	C-T	HET
SBS	Chr5	5289565	C-T	Homo
SBS	Chr5	6142040	G-T	Homo
SBS	Chr5	10456929	G-A	HET
SBS	Chr5	12559577	C-T	HET
SBS	Chr5	14063466	C-T	HET
SBS	Chr5	15082575	A-T	HET
SBS	Chr5	15358663	G-T	HET
SBS	Chr5	22462289	C-T	HET
SBS	Chr6	902432	C-A	HET
SBS	Chr6	23137542	T-A	HET
SBS	Chr6	27215250	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g44990
SBS	Chr6	30763282	G-A	HET
SBS	Chr8	13438555	C-T	HET
SBS	Chr8	17394624	T-C	HET
SBS	Chr8	25722962	C-T	HET
SBS	Chr9	3161287	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g06650
SBS	Chr9	4515816	C-T	HET
SBS	Chr9	6882753	T-C	HET
SBS	Chr9	8139339	T-C	HET
SBS	Chr9	22237780	A-G	HET
SBS	Chr10	4739072	C-T	HET
SBS	Chr10	13990663	G-A	Homo
SBS	Chr10	23034384	A-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g42700
SBS	Chr11	395468	T-A	HET
SBS	Chr11	5736916	G-C	HET
SBS	Chr11	19397810	T-C	HET
SBS	Chr11	24826885	A-T	HET
SBS	Chr11	28488125	G-A	HET
SBS	Chr12	458063	G-T	HET
SBS	Chr12	1799802	G-T	HET
SBS	Chr12	6793390	A-T	HET
SBS	Chr12	8922609	G-A	Homo
SBS	Chr12	19323886	G-T	HET

Deletions: 15

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr1	1257702	1257708	6
Deletion	Chr2	1271720	1271722	2
Deletion	Chr11	3119088	3119093	5
Deletion	Chr5	8244364	8244373	9
Deletion	Chr4	14202914	14202919	5
Deletion	Chr10	14993791	14993792	1	LOC_Os10g28724
Deletion	Chr3	21940807	21940814	7	LOC_Os03g39500
Deletion	Chr2	23920001	23934000	13999
Deletion	Chr3	24545227	24545240	13
Deletion	Chr8	24712084	24712090	6
Deletion	Chr4	25183404	25183405	1	LOC_Os04g42570
Deletion	Chr7	25570867	25570868	1
Deletion	Chr6	28212001	28223000	10999
Deletion	Chr3	31698510	31698512	2
Deletion	Chr3	34453414	34453429	15

Insertions: 6

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr3	27465312	27465312	1
Insertion	Chr3	28113975	28113976	2
Insertion	Chr5	4914334	4914336	3
Insertion	Chr5	29163155	29163156	2
Insertion	Chr8	28111380	28111381	2
Insertion	Chr12	513630	513632	3

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr4	25388592	25834183	2
Inversion	Chr4	25389462	25834192	2

Translocations: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr8	1840145	Chr3	30508300
Translocation	Chr10	13650187	Chr6	16152481	2
Translocation	Chr12	13936898	Chr4	16502356	LOC_Os12g24420

Main menu