Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 42

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	36151124	A-G	HET
SBS	Chr1	38984093	C-T	HET
SBS	Chr1	40183709	T-C	HET
SBS	Chr1	41328343	C-A	HET
SBS	Chr2	4414162	A-T	HET
SBS	Chr2	8042036	A-G	HET
SBS	Chr2	15418980	G-A	HET
SBS	Chr3	261013	A-C	HET
SBS	Chr3	725424	T-A	HET
SBS	Chr3	11585030	C-T	Homo
SBS	Chr3	15099624	C-T	Homo
SBS	Chr3	32818694	C-T	HET
SBS	Chr4	5453367	A-G	HET
SBS	Chr4	21252119	G-A	Homo
SBS	Chr4	32420949	G-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g54500
SBS	Chr5	3657891	A-T	Homo
SBS	Chr5	12275813	C-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g20900
SBS	Chr5	19039232	G-A	HET
SBS	Chr5	25684646	T-C	HET
SBS	Chr6	5465718	A-T	HET
SBS	Chr6	15143508	G-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g25890
SBS	Chr6	15143509	C-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g25890
SBS	Chr7	6214434	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g11270
SBS	Chr7	29147884	G-A	HET
SBS	Chr8	2503090	T-A	HET
SBS	Chr8	4993546	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g08640
SBS	Chr8	7037179	G-T	HET
SBS	Chr8	11142737	G-A	HET
SBS	Chr8	11142738	A-T	HET
SBS	Chr8	11253197	G-A	HET
SBS	Chr8	28026580	G-A	HET
SBS	Chr9	4093016	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g07960
SBS	Chr9	6964133	T-G	HET
SBS	Chr9	22637575	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g39360
SBS	Chr10	10582693	C-G	HET
SBS	Chr10	14174029	A-G	HET
SBS	Chr10	17098625	A-T	HET
SBS	Chr11	9845988	C-T	Homo
SBS	Chr11	22228024	G-A	HET
SBS	Chr11	23604929	G-A	HET
SBS	Chr12	11660349	A-G	HET
SBS	Chr12	13462495	A-T	HET

Deletions: 12

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr10	7446765	7446766	1
Deletion	Chr4	9333800	9333804	4
Deletion	Chr10	10862267	10862268	1	LOC_Os10g21268
Deletion	Chr3	11591215	11591217	2
Deletion	Chr1	12637446	12637447	1
Deletion	Chr4	20830968	20830970	2
Deletion	Chr2	21353744	21353745	1
Deletion	Chr7	25629433	25629435	2
Deletion	Chr12	26403195	26403197	2
Deletion	Chr4	26521911	26521919	8
Deletion	Chr1	27404281	27404301	20
Deletion	Chr8	27576496	27576497	1	LOC_Os08g43600

Insertions: 7

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr5	17413328	17413328	1	LOC_Os05g30090
Insertion	Chr5	20332417	20332418	2
Insertion	Chr8	3541926	3541928	3
Insertion	Chr12	514165	514171	7
Insertion	Chr5	29124358	29124428	71
Insertion	Chr6	17523889	17523892	4	LOC_Os06g30340
Insertion	Chr12	13988854	13988918	65

Inversions: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr10	13165539	13479187

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2
Translocation	Chr9	1075850	Chr7	14960188
Translocation	Chr9	1076219	Chr7	3998831
Translocation	Chr11	10924259	Chr2	9805734
Translocation	Chr6	14031761	Chr3	12503655

Main menu