Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 44

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	14491430	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g25580
SBS	Chr1	14491431	T-C	HET
SBS	Chr1	15099786	C-A	HET
SBS	Chr1	17520335	G-A	HET
SBS	Chr1	23370560	G-A	HET
SBS	Chr1	26708387	C-A	HET
SBS	Chr1	26780869	C-T	HET
SBS	Chr1	30086750	G-A	HET
SBS	Chr1	39248894	C-T	HET
SBS	Chr2	1595796	G-A	HET
SBS	Chr2	35487409	T-C	HET
SBS	Chr3	12353694	G-A	HET
SBS	Chr3	13685441	C-T	HET
SBS	Chr3	17072771	C-T	HET
SBS	Chr3	21099192	T-A	HET
SBS	Chr3	21099194	G-T	HET
SBS	Chr3	27227363	T-C	Homo
SBS	Chr4	686291	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g02110
SBS	Chr4	3282652	T-A	HET
SBS	Chr4	3282657	C-A	HET
SBS	Chr4	17157655	C-T	HET
SBS	Chr4	22292443	T-A	HET
SBS	Chr4	30496771	T-A	HET
SBS	Chr5	6289305	G-A	HET
SBS	Chr5	17394022	C-G	HET
SBS	Chr5	17533564	T-C	HET
SBS	Chr5	23010966	G-T	HET
SBS	Chr6	5012289	A-T	HET
SBS	Chr6	17680227	C-A	Homo
SBS	Chr6	29135124	G-T	HET
SBS	Chr6	30093188	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g49750
SBS	Chr7	1016284	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g02780
SBS	Chr7	20221691	G-A	HET
SBS	Chr7	21300207	G-A	HET
SBS	Chr7	21300208	C-T	HET
SBS	Chr7	25481770	T-A	HET
SBS	Chr8	10814592	C-T	Homo
SBS	Chr8	15905047	C-G	Homo
SBS	Chr8	21915372	C-A	Homo
SBS	Chr9	2992485	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g06360
SBS	Chr12	1556247	C-G	HET
SBS	Chr12	6922202	T-A	HET
SBS	Chr12	13616221	C-G	HET
SBS	Chr12	25852528	A-C	HET

Deletions: 10

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr6	2708894	2708900	6
Deletion	Chr12	3332209	3332211	2
Deletion	Chr7	7251025	7251026	1	LOC_Os07g12690
Deletion	Chr2	15903723	15903739	16	LOC_Os02g27050
Deletion	Chr7	18477142	18477144	2
Deletion	Chr11	19122735	19122753	18
Deletion	Chr7	26145275	26145276	1
Deletion	Chr5	27998946	27998961	15
Deletion	Chr1	30598275	30598277	2
Deletion	Chr1	38478256	38478262	6

Insertions: 7

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr3	25119782	25119782	1
Insertion	Chr6	12398587	12398588	2
Insertion	Chr2	18680854	18680854	1	LOC_Os02g31190
Insertion	Chr2	30195149	30195149	1
Insertion	Chr5	11128475	11128475	1
Insertion	Chr10	2694374	2694381	8	2
Insertion	Chr10	2694374	2694397	24	2

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr3	1109537	1109731	LOC_Os03g02840
Inversion	Chr11	8286635	8287171

Translocations: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2
Translocation	Chr9	11971553	Chr2	24766491
Translocation	Chr11	18279665	Chr3	29622495
Translocation	Chr7	21153959	Chr3	18695239

Main menu