Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 36

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	23883759	G-A	HET
SBS	Chr2	8388572	A-T	HET
SBS	Chr2	14892094	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g25500
SBS	Chr2	19419298	C-T	Homo
SBS	Chr2	19609949	G-A	Homo
SBS	Chr2	27056831	T-G	HET
SBS	Chr3	14877860	C-T	HET
SBS	Chr3	17594045	A-G	Homo
SBS	Chr3	29372757	G-C	HET
SBS	Chr3	33234849	G-T	HET
SBS	Chr3	35813782	A-G	HET
SBS	Chr4	10440031	T-C	HET
SBS	Chr4	16272676	C-T	HET
SBS	Chr4	25745576	C-A	HET
SBS	Chr5	11336547	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g19500
SBS	Chr5	18805385	C-T	HET
SBS	Chr6	1421625	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g03650
SBS	Chr6	2099742	T-C	HET
SBS	Chr7	14480625	G-A	HET
SBS	Chr7	18965286	C-T	HET
SBS	Chr7	22826440	G-A	HET
SBS	Chr8	15782063	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g25940
SBS	Chr8	21128012	C-T	Homo
SBS	Chr9	17868555	G-A	HET
SBS	Chr9	17892820	C-T	HET
SBS	Chr9	18032127	G-T	HET
SBS	Chr10	4291500	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g07998
SBS	Chr10	12339555	T-A	HET
SBS	Chr11	5194799	G-A	Homo
SBS	Chr11	6427772	T-C	Homo
SBS	Chr11	13059368	A-G	HET
SBS	Chr11	14215668	G-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g24964
SBS	Chr11	21330742	C-T	HET
SBS	Chr12	10005391	A-T	HET
SBS	Chr12	20332964	G-A	HET
SBS	Chr12	20332965	C-A	HET

Deletions: 13

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr3	3060289	3060290	1
Deletion	Chr6	3977808	3977816	8
Deletion	Chr12	4350777	4350800	23
Deletion	Chr3	9921216	9921219	3
Deletion	Chr8	12771397	12771409	12
Deletion	Chr3	13177289	13177302	13
Deletion	Chr9	14938658	14938664	6	LOC_Os09g25000
Deletion	Chr1	21227472	21227473	1
Deletion	Chr5	26009564	26009565	1
Deletion	Chr3	26533619	26533620	1	LOC_Os03g46920
Deletion	Chr5	28885305	28885307	2
Deletion	Chr3	32940836	32940839	3	LOC_Os03g57808
Deletion	Chr1	35263113	35263115	2

Insertions: 1

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr5	27328734	27328734	1

Inversions: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr1	6800006	6800220
Inversion	Chr1	6800113	6800478
Inversion	Chr5	10064009	10198790	2
Inversion	Chr6	11422886	11964216
Inversion	Chr4	17847504	18125032	2

Translocations: 9

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr10	2757414	Chr1	33506471	2
Translocation	Chr10	6421148	Chr4	4049999	LOC_Os10g11630
Translocation	Chr10	11338577	Chr5	5644607	2
Translocation	Chr8	14501791	Chr6	8672219
Translocation	Chr3	15238097	Chr2	3401796
Translocation	Chr4	16536350	Chr1	41351273	2
Translocation	Chr3	18216525	Chr1	25578272	LOC_Os03g31839
Translocation	Chr7	25192918	Chr2	19585394	LOC_Os07g42080
Translocation	Chr8	28053077	Chr6	24355944

Main menu