Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 39

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	4359997	A-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g08720
SBS	Chr1	39645418	C-T	HET
SBS	Chr1	42121145	A-T	HET
SBS	Chr3	3788914	C-T	HET
SBS	Chr3	21563266	G-A	HET
SBS	Chr3	23080706	G-A	HET
SBS	Chr3	29419488	C-A	Homo
SBS	Chr3	31180705	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g54860
SBS	Chr4	1202107	T-A	HET
SBS	Chr4	3283650	T-C	HET
SBS	Chr4	13770780	G-A	HET
SBS	Chr4	15940440	C-T	HET
SBS	Chr4	20648675	G-T	Homo
SBS	Chr4	25834734	C-T	Homo
SBS	Chr5	3307751	T-G	Homo
SBS	Chr5	11230179	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g19330
SBS	Chr5	12908587	T-C	HET
SBS	Chr5	13742346	C-G	HET
SBS	Chr5	16464327	T-A	HET
SBS	Chr5	22203389	C-T	HET
SBS	Chr6	11038907	C-T	HET
SBS	Chr6	12340025	C-A	HET
SBS	Chr7	9755543	C-T	HET
SBS	Chr7	21461588	T-A	Homo
SBS	Chr8	18669673	G-A	HET
SBS	Chr8	28300076	T-C	HET
SBS	Chr8	28366714	T-C	HET
SBS	Chr9	5301295	G-A	Homo
SBS	Chr10	2031083	T-C	Homo
SBS	Chr10	5954394	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g10770
SBS	Chr10	7231041	C-T	HET
SBS	Chr11	8628540	A-C	HET
SBS	Chr11	8993735	G-T	HET
SBS	Chr11	8993736	C-T	HET
SBS	Chr11	10471794	G-C	HET
SBS	Chr11	13416717	G-T	HET
SBS	Chr11	16034368	G-C	HET
SBS	Chr11	16455043	C-T	HET
SBS	Chr12	12415500	T-C	Homo

Deletions: 15

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr1	582201	582202	1
Deletion	Chr8	1923153	1923156	3
Deletion	Chr1	2650176	2650342	166
Deletion	Chr6	4646001	4672000	25999	6
Deletion	Chr12	11000633	11000644	11
Deletion	Chr2	12252808	12252809	1
Deletion	Chr8	15512146	15512148	2
Deletion	Chr1	16024170	16024176	6
Deletion	Chr12	19920391	19920402	11
Deletion	Chr9	21050293	21050294	1
Deletion	Chr3	21776121	21776124	3	LOC_Os03g39210
Deletion	Chr6	24537399	24537400	1
Deletion	Chr7	24578001	24600000	21999	2
Deletion	Chr6	26698116	26698117	1
Deletion	Chr11	26742137	26742140	3	LOC_Os11g44250

Insertions: 1

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr5	5166353	5166354	2

Inversions: 6

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr2	561417	1485087	2
Inversion	Chr1	802184	1214612
Inversion	Chr11	8409271	8641944	2
Inversion	Chr11	8438001	8644451
Inversion	Chr2	27006862	27198432
Inversion	Chr2	28198620	28345225	LOC_Os02g46240

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr8	9066521	Chr7	24574932
Translocation	Chr8	9066522	Chr7	24576778	2
Translocation	Chr8	14568616	Chr4	17539892	2
Translocation	Chr10	16806304	Chr9	2550041	2

Main menu