Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 49

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	9377801	T-A	HET
SBS	Chr1	17526113	G-A	Homo
SBS	Chr1	21340850	G-A	Homo
SBS	Chr1	23755260	A-G	Homo
SBS	Chr1	28805962	G-A	HET
SBS	Chr1	33427861	C-T	HET
SBS	Chr2	11845502	G-A	Homo
SBS	Chr2	16807470	T-G	Homo
SBS	Chr2	18748123	C-T	HET
SBS	Chr2	20628736	C-T	HET
SBS	Chr2	33025248	A-T	HET
SBS	Chr2	33619996	C-G	HET
SBS	Chr3	16341713	A-G	HET
SBS	Chr3	19538815	G-T	HET
SBS	Chr3	21457681	C-T	HET
SBS	Chr3	30824079	T-C	HET
SBS	Chr4	14547660	G-A	Homo
SBS	Chr4	23671027	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g39720
SBS	Chr4	24583559	T-C	HET
SBS	Chr5	8525806	C-A	HET
SBS	Chr5	8525807	A-C	HET
SBS	Chr5	23820167	C-A	HET
SBS	Chr6	1176712	C-T	HET
SBS	Chr6	11440144	C-T	HET
SBS	Chr6	11440145	A-G	HET
SBS	Chr6	13266138	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g22790
SBS	Chr6	16882444	A-G	HET
SBS	Chr7	918120	G-A	Homo
SBS	Chr7	8926503	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g15430
SBS	Chr7	13659395	G-A	HET
SBS	Chr7	16932504	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g28880
SBS	Chr7	26712115	C-T	HET
SBS	Chr8	17525585	G-A	HET
SBS	Chr8	25161742	T-A	Homo
SBS	Chr9	3039241	G-A	HET
SBS	Chr9	6321943	G-A	Homo
SBS	Chr9	7126269	G-A	HET
SBS	Chr9	13115129	A-G	Homo
SBS	Chr10	12722048	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g24730
SBS	Chr10	17479646	C-T	HET
SBS	Chr10	20040719	G-C	HET
SBS	Chr11	15876750	G-A	HET
SBS	Chr11	16644420	G-A	HET
SBS	Chr11	25586323	C-A	HET
SBS	Chr11	26079703	C-G	HET
SBS	Chr12	285128	G-A	HET
SBS	Chr12	4546348	T-C	HET
SBS	Chr12	10412494	C-T	Homo
SBS	Chr12	11648761	G-A	Homo

Deletions: 10

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	1234773	1234775	2
Deletion	Chr7	5454778	5454779	1	LOC_Os07g10150
Deletion	Chr6	8504233	8504234	1
Deletion	Chr1	11505195	11505201	6	LOC_Os01g20206
Deletion	Chr11	16511663	16511670	7	LOC_Os11g28610
Deletion	Chr3	18462369	18462370	1
Deletion	Chr4	19504015	19504016	1
Deletion	Chr1	22081085	22081088	3
Deletion	Chr3	25785177	25785186	9
Deletion	Chr2	32101737	32101744	7

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr8	17124822	17124822	1
Insertion	Chr5	15682444	15682446	3
Insertion	Chr11	15744837	15744837	1

Inversions: 8

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr5	4699352	4699743	2
Inversion	Chr4	11522318	11522644
Inversion	Chr3	13507622	13559269
Inversion	Chr9	15406637	15406940
Inversion	Chr12	17965336	17965744	LOC_Os12g30030
Inversion	Chr8	18550628	18929789
Inversion	Chr8	18550631	18929795
Inversion	Chr8	25272200	25272581	LOC_Os08g39880

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr6	3342697	Chr3	36207298	LOC_Os06g07040
Translocation	Chr6	3343201	Chr3	36207293	LOC_Os06g07040
Translocation	Chr4	16444940	Chr1	1516673	2
Translocation	Chr6	29548186	Chr5	1837432

Main menu