Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 38

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	21197418	A-T	Homo
SBS	Chr1	25267154	C-A	HET
SBS	Chr1	28083900	G-A	Homo
SBS	Chr1	36630889	C-T	HET
SBS	Chr1	39093424	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g67340
SBS	Chr1	40771438	G-T	HET
SBS	Chr1	41773418	G-C	HET
SBS	Chr2	12115347	G-A	HET
SBS	Chr2	21641833	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g36020
SBS	Chr2	25002959	C-T	HET
SBS	Chr2	31961111	G-A	HET
SBS	Chr3	3521766	A-G	HET
SBS	Chr3	19265016	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g33680
SBS	Chr3	29051881	G-C	Homo
SBS	Chr4	1826315	G-A	Homo
SBS	Chr4	6966229	T-G	Homo
SBS	Chr4	15046990	G-A	HET
SBS	Chr4	19600623	G-A	HET
SBS	Chr4	20951097	C-T	HET
SBS	Chr4	34683919	A-C	HET
SBS	Chr5	218454	T-A	HET
SBS	Chr5	6816534	T-C	HET
SBS	Chr5	29291183	G-T	HET
SBS	Chr6	13800821	A-C	HET
SBS	Chr6	14457829	C-T	HET
SBS	Chr8	851286	T-A	Homo
SBS	Chr8	19079411	C-A	HET
SBS	Chr9	6892318	C-T	Homo
SBS	Chr9	10373772	A-T	Homo
SBS	Chr9	10373773	C-T	Homo
SBS	Chr9	20726018	C-T	HET
SBS	Chr10	4975239	G-A	HET
SBS	Chr10	5146142	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g09529
SBS	Chr10	6880408	G-A	HET
SBS	Chr10	14663307	G-A	HET
SBS	Chr11	22399896	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g37820
SBS	Chr12	18177887	A-G	HET
SBS	Chr12	19728029	C-T	HET

Deletions: 13

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr4	411061	411065	4	LOC_Os04g01610
Deletion	Chr7	472142	472148	6
Deletion	Chr4	2263640	2263641	1
Deletion	Chr3	4125119	4125121	2
Deletion	Chr9	6865549	6865553	4
Deletion	Chr9	8232606	8232608	2
Deletion	Chr4	8259689	8259704	15
Deletion	Chr4	9824713	9824714	1	LOC_Os04g17880
Deletion	Chr6	15247925	15247926	1
Deletion	Chr6	19934029	19934034	5
Deletion	Chr1	20299847	20299856	9
Deletion	Chr12	22659453	22659455	2
Deletion	Chr2	25749001	25869000	119999	13

Insertions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr5	5266970	5266971	2
Insertion	Chr5	8801263	8801263	1

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr4	1148732	1894432	2
Inversion	Chr4	1894426	1965900	LOC_Os04g04100

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr7	1136004	Chr2	25693442
Translocation	Chr7	1138568	Chr2	25872480	2
Translocation	Chr7	11200526	Chr3	25420997	2
Translocation	Chr12	23372446	Chr4	31946249	2

Main menu