Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 45

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	10426977	C-T	HET
SBS	Chr1	25650325	C-T	HET
SBS	Chr1	28115448	G-A	HET
SBS	Chr1	29323621	T-C	Homo
SBS	Chr1	30411020	G-T	Homo
SBS	Chr1	31444199	A-G	HET
SBS	Chr2	7894041	T-G	Homo
SBS	Chr2	22684273	C-G	HET
SBS	Chr2	25507501	G-T	HET
SBS	Chr3	1183475	G-T	HET
SBS	Chr3	4177373	T-C	HET
SBS	Chr3	21399751	G-A	Homo
SBS	Chr3	23123639	G-A	Homo
SBS	Chr3	29433879	A-T	HET
SBS	Chr3	32034330	G-A	HET
SBS	Chr4	2013333	C-T	HET
SBS	Chr4	6808590	G-A	HET
SBS	Chr4	9439873	G-A	HET
SBS	Chr4	10202162	C-T	HET
SBS	Chr4	10496618	C-T	HET
SBS	Chr4	11276130	A-C	HET
SBS	Chr5	4727757	T-A	HET
SBS	Chr5	8336797	G-A	HET
SBS	Chr5	16116140	C-A	HET
SBS	Chr5	16825168	C-T	Homo
SBS	Chr5	17658659	G-A	Homo
SBS	Chr5	22667369	G-T	HET
SBS	Chr5	29522121	G-A	HET
SBS	Chr6	6264957	C-T	HET
SBS	Chr6	8516138	C-T	HET
SBS	Chr6	12243697	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g21180
SBS	Chr7	13684359	C-A	HET
SBS	Chr8	9153722	C-G	HET
SBS	Chr8	13685898	G-A	HET
SBS	Chr8	25795330	A-T	Homo
SBS	Chr9	14993972	T-C	Homo
SBS	Chr10	9152146	C-T	HET
SBS	Chr10	10025496	C-G	HET
SBS	Chr11	4848926	C-T	HET
SBS	Chr11	16707772	C-T	HET
SBS	Chr12	642936	A-G	Homo
SBS	Chr12	2909886	A-C	HET
SBS	Chr12	11330083	G-A	HET
SBS	Chr12	12483455	C-T	HET
SBS	Chr12	14799005	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g25570

Deletions: 19

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr1	6050159	6050171	12
Deletion	Chr10	6817709	6817721	12
Deletion	Chr10	11833341	11833347	6
Deletion	Chr10	13138286	13138287	1
Deletion	Chr2	13641254	13641409	155
Deletion	Chr8	15448222	15448223	1
Deletion	Chr12	17601559	17601562	3
Deletion	Chr7	20533740	20533753	13
Deletion	Chr12	20827807	20827828	21
Deletion	Chr11	24221412	24221416	4	LOC_Os11g40590
Deletion	Chr8	25746715	25746722	7	LOC_Os08g40660
Deletion	Chr8	25808122	25808153	31	LOC_Os08g40800
Deletion	Chr3	28307001	28421000	113999	14
Deletion	Chr1	29240753	29240757	4
Deletion	Chr1	32511001	32526000	14999	4
Deletion	Chr1	32932415	32932420	5
Deletion	Chr1	33324001	33353000	28999	5
Deletion	Chr1	33413001	33422000	8999	2
Deletion	Chr2	34159044	34159051	7

Insertions: 4

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr6	15115063	15115064	2
Insertion	Chr4	15065348	15065348	1
Insertion	Chr11	1476412	1476413	2
Insertion	Chr11	18868746	18868749	4

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr4	12395616	12599098	2
Inversion	Chr4	12395635	12599103	2

Translocations: 14

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr7	4974504	Chr5	3013924
Translocation	Chr7	5717669	Chr6	16966630
Translocation	Chr9	6720401	Chr1	41116090
Translocation	Chr4	11340336	Chr2	3399404
Translocation	Chr11	13236365	Chr7	19139217
Translocation	Chr3	14255790	Chr2	17025208	2
Translocation	Chr7	15132405	Chr3	13647112
Translocation	Chr11	15551931	Chr7	11770302
Translocation	Chr6	16700422	Chr1	2811439	2
Translocation	Chr12	17128892	Chr3	27794630
Translocation	Chr10	21215622	Chr4	7374045
Translocation	Chr10	21216840	Chr4	7374038
Translocation	Chr7	21657419	Chr4	31867761
Translocation	Chr12	22666467	Chr6	7316864

Main menu