Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 43

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	15873160	G-A	Homo
SBS	Chr1	22329456	A-T	HET
SBS	Chr1	22342160	G-A	HET
SBS	Chr1	22414089	T-A	HET
SBS	Chr1	35670846	G-A	HET
SBS	Chr2	1705888	A-T	Homo
SBS	Chr2	1705895	T-A	Homo
SBS	Chr2	3942422	C-T	HET
SBS	Chr2	14191820	G-C	HET
SBS	Chr2	27110518	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g44740
SBS	Chr2	34367351	G-T	HET
SBS	Chr3	11387509	G-C	HET
SBS	Chr4	3157917	C-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g06080
SBS	Chr4	3356652	C-A	HET
SBS	Chr4	6654564	A-G	HET
SBS	Chr4	8875748	G-A	HET
SBS	Chr4	17815792	C-T	HET
SBS	Chr4	24111872	C-T	HET
SBS	Chr4	25262560	T-C	HET
SBS	Chr4	29581265	G-A	Homo
SBS	Chr5	1918505	G-T	HET
SBS	Chr5	1918506	C-A	HET
SBS	Chr5	1918510	G-C	HET
SBS	Chr5	15431205	C-T	HET
SBS	Chr5	21103087	A-G	HET
SBS	Chr6	8095880	T-A	HET
SBS	Chr6	13784173	C-A	Homo
SBS	Chr6	20961418	C-A	Homo
SBS	Chr6	30931982	C-T	HET
SBS	Chr7	7559716	C-T	HET
SBS	Chr7	19589175	C-T	HET
SBS	Chr7	19651198	G-T	Homo
SBS	Chr8	23269321	A-T	HET
SBS	Chr8	24503083	C-T	HET
SBS	Chr9	2249022	T-C	HET
SBS	Chr10	4879439	A-G	HET
SBS	Chr10	11847662	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g22800
SBS	Chr11	11679980	G-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g20220
SBS	Chr11	16034828	C-T	Homo
SBS	Chr11	24640060	A-C	HET
SBS	Chr11	26814340	T-A	HET
SBS	Chr12	633816	A-C	HET
SBS	Chr12	1705647	G-A	HET	STOP_GAINED	LOC_Os12g04050

Deletions: 8

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr1	5866746	5866755	9
Deletion	Chr2	8888674	8888675	1
Deletion	Chr5	16508714	16508715	1
Deletion	Chr7	19613001	19643000	29999	5
Deletion	Chr12	21129441	21129443	2
Deletion	Chr5	25660375	25660377	2
Deletion	Chr12	26712100	26712103	3
Deletion	Chr3	32385733	32385740	7

Insertions: 6

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr3	27485722	27485723	2
Insertion	Chr10	10023519	10023520	2
Insertion	Chr1	14535519	14535519	1
Insertion	Chr4	22679214	22679214	1
Insertion	Chr5	15012379	15012406	28
Insertion	Chr7	21737623	21737623	1

No Inversion

Translocations: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr12	5384427	Chr2	16818173
Translocation	Chr7	9604616	Chr3	25732270
Translocation	Chr10	13993045	Chr9	3625207	2

Main menu