Search Nipponbare

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 42

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	14971539	T-A	HET
SBS	Chr1	22339380	T-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g39600
SBS	Chr1	36594015	G-A	HET
SBS	Chr10	10494017	G-A	HET
SBS	Chr10	14667282	A-G	HET
SBS	Chr10	18813485	A-G	HET
SBS	Chr10	4704323	C-T	HET
SBS	Chr11	1298030	G-A	HET
SBS	Chr11	19392843	T-A	Homo
SBS	Chr11	21306961	C-T	HET
SBS	Chr2	14528882	T-A	HET
SBS	Chr2	18738977	A-G	Homo
SBS	Chr2	28564817	T-C	Homo
SBS	Chr2	35230731	C-T	HET
SBS	Chr2	9382169	C-T	HET
SBS	Chr2	9596245	G-C	HET
SBS	Chr3	12898876	C-T	Homo
SBS	Chr3	14217254	G-T	Homo
SBS	Chr3	21822869	G-A	HET	STOP_GAINED	LOC_Os03g39284
SBS	Chr3	6360077	T-A	HET
SBS	Chr3	8211090	G-A	HET
SBS	Chr3	9477253	C-T	HET
SBS	Chr4	26170539	C-T	Homo
SBS	Chr4	28943121	T-G	Homo
SBS	Chr4	2995109	G-T	HET
SBS	Chr4	5449734	G-A	HET
SBS	Chr4	6151608	G-A	HET
SBS	Chr4	7839825	G-A	HET
SBS	Chr5	15031589	A-G	Homo
SBS	Chr5	21938540	G-A	HET
SBS	Chr5	5496813	C-T	HET
SBS	Chr5	5585054	G-A	Homo
SBS	Chr6	14399996	G-A	Homo
SBS	Chr6	28933990	G-A	HET
SBS	Chr6	4047616	T-A	Homo
SBS	Chr7	231339	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g01360
SBS	Chr7	28006592	G-A	HET
SBS	Chr7	9777578	G-A	HET
SBS	Chr8	27495602	G-A	HET
SBS	Chr8	9113028	G-C	Homo
SBS	Chr9	10235911	A-G	Homo
SBS	Chr9	9818549	T-A	Homo

Deletions: 16

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr6	6214644	6214646	2
Deletion	Chr4	8068382	8068383	1
Deletion	Chr3	10576490	10576494	4
Deletion	Chr5	10622104	10622105	1
Deletion	Chr11	10859151	10859153	2
Deletion	Chr1	11062457	11062458	1	LOC_Os01g19480
Deletion	Chr6	11582449	11582471	22
Deletion	Chr3	15068001	15074000	5999	2
Deletion	Chr10	16486115	16486127	12
Deletion	Chr5	16791588	16791604	16
Deletion	Chr4	18313000	18313007	7
Deletion	Chr8	21896242	21896259	17
Deletion	Chr1	25766602	25766603	1
Deletion	Chr4	26356624	26356627	3
Deletion	Chr2	27548960	27548961	1
Deletion	Chr1	28405543	28405548	5

Insertions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr2	11068831	11068833	3
Insertion	Chr7	22212390	22212391	2

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr1	7902712	8389181
Inversion	Chr1	7902784	8389188

Translocations: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr6	16040202	Chr4	11855994

Main menu