Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 34

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	9652763	T-A	HET
SBS	Chr1	24746497	C-T	Homo
SBS	Chr1	31823343	C-T	HET
SBS	Chr1	42006993	A-T	HET
SBS	Chr3	15942948	T-A	HET
SBS	Chr3	18703515	G-C	HET
SBS	Chr3	25385275	T-C	Homo
SBS	Chr3	30231722	C-A	Homo
SBS	Chr4	16800835	A-G	HET
SBS	Chr4	17328039	C-T	HET
SBS	Chr4	33232817	C-T	HET
SBS	Chr4	35269975	T-C	HET
SBS	Chr5	7208417	C-G	Homo
SBS	Chr5	18667547	C-T	HET
SBS	Chr6	19994092	A-T	HET
SBS	Chr7	4188872	A-T	HET
SBS	Chr7	12991614	G-A	HET
SBS	Chr7	13435086	G-T	HET
SBS	Chr7	17070887	C-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g29160
SBS	Chr8	13375747	A-G	HET
SBS	Chr8	13375752	A-T	HET
SBS	Chr8	13507007	A-T	HET
SBS	Chr8	13507008	A-T	HET
SBS	Chr8	18992128	C-T	HET
SBS	Chr9	1254066	C-T	HET
SBS	Chr10	11845146	G-A	Homo
SBS	Chr10	14308622	C-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g27150
SBS	Chr10	14991320	C-A	HET
SBS	Chr10	14999971	T-A	HET
SBS	Chr10	15686622	T-C	HET
SBS	Chr11	7840358	G-A	Homo
SBS	Chr11	20298828	G-A	HET
SBS	Chr12	16535509	C-T	Homo
SBS	Chr12	26123264	A-T	HET

Deletions: 9

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Deletion	Chr3	2355099	2355100	1
Deletion	Chr5	4702636	4702663	27
Deletion	Chr9	6886375	6886403	28
Deletion	Chr3	9187117	9187129	12
Deletion	Chr2	11700978	11700991	13
Deletion	Chr1	12904261	12904264	3
Deletion	Chr12	17638257	17638259	2
Deletion	Chr4	26432420	26432426	6
Deletion	Chr1	39197105	39197112	7

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr12	11952720	11952721	2
Insertion	Chr4	1579844	1579875	32
Insertion	Chr4	3219839	3219840	2

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr9	14376594	14377173
Inversion	Chr10	21837493	22244940	2
Inversion	Chr10	21837498	22244938	2

No Translocation

Main menu