Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 33

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	15170970	C-G	Homo
SBS	Chr1	30850149	T-C	HET
SBS	Chr1	37923791	C-T	HET
SBS	Chr1	39716327	G-A	HET
SBS	Chr1	41588787	A-C	HET
SBS	Chr2	9200857	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g16190
SBS	Chr2	11795839	G-A	HET	STOP_GAINED	LOC_Os02g20030
SBS	Chr2	20286495	G-A	HET
SBS	Chr2	34559129	G-A	Homo
SBS	Chr3	1572109	C-T	HET
SBS	Chr3	1812947	A-G	HET
SBS	Chr3	8813447	G-A	HET
SBS	Chr3	17307669	G-C	Homo
SBS	Chr4	2426626	A-C	HET
SBS	Chr4	10874229	G-T	HET
SBS	Chr4	13449686	G-C	HET
SBS	Chr4	26437076	T-G	HET
SBS	Chr4	32045867	A-T	HET
SBS	Chr5	16819965	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g28670
SBS	Chr5	18645502	C-G	HET
SBS	Chr6	6738459	G-A	HET
SBS	Chr6	7891788	C-T	HET
SBS	Chr6	9506227	T-C	HET
SBS	Chr6	28320209	C-A	Homo
SBS	Chr8	12564910	G-T	HET
SBS	Chr10	1138324	G-T	Homo
SBS	Chr10	8705728	A-G	HET
SBS	Chr10	17568485	C-T	Homo
SBS	Chr11	6510889	G-A	Homo
SBS	Chr11	10507117	A-G	Homo
SBS	Chr11	11358124	G-C	Homo
SBS	Chr12	11262577	A-G	HET
SBS	Chr12	24539957	C-T	Homo

Deletions: 10

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	4065669	4065676	7
Deletion	Chr10	4315974	4315986	12
Deletion	Chr5	5797905	5797906	1
Deletion	Chr9	6788842	6788843	1
Deletion	Chr11	10350156	10350158	2
Deletion	Chr8	11165820	11165885	65	LOC_Os08g18220
Deletion	Chr10	16683165	16683181	16
Deletion	Chr10	18240412	18240413	1
Deletion	Chr11	25740024	25740027	3
Deletion	Chr4	30778952	30778953	1

Insertions: 6

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr11	17669197	17669198	2
Insertion	Chr1	2675515	2675578	64
Insertion	Chr1	5943189	5943203	15
Insertion	Chr2	1506963	1506963	1
Insertion	Chr3	10745204	10745204	1
Insertion	Chr10	5956549	5956549	1

Inversions: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr9	2357526	2390395	LOC_Os09g04440
Inversion	Chr9	2357527	2390391	LOC_Os09g04440
Inversion	Chr9	8953674	9368100	2
Inversion	Chr9	8953680	9368126	2

Translocations: 7

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr8	316710	Chr3	16770706
Translocation	Chr10	5559721	Chr7	10762025	LOC_Os10g10140
Translocation	Chr8	10668730	Chr6	18881069	2
Translocation	Chr9	13488872	Chr1	40016733	2
Translocation	Chr9	13489249	Chr1	40016733	2
Translocation	Chr12	16453447	Chr9	13333418	2
Translocation	Chr4	35463158	Chr3	12863838

Main menu