Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 34

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	935424	C-A	HET
SBS	Chr1	19019773	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g34490
SBS	Chr1	39359448	C-G	HET
SBS	Chr1	42413270	C-T	Homo
SBS	Chr2	17654095	C-G	HET
SBS	Chr2	23068216	G-A	HET
SBS	Chr2	29296751	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g47890
SBS	Chr2	32716873	A-T	Homo
SBS	Chr2	32716874	C-T	Homo
SBS	Chr3	20110620	T-G	HET
SBS	Chr4	69715	A-G	HET
SBS	Chr4	377549	C-T	HET
SBS	Chr4	13740520	C-T	HET
SBS	Chr4	23250737	C-A	HET
SBS	Chr4	34218823	T-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g57520
SBS	Chr5	12832354	G-A	HET
SBS	Chr5	14744316	A-G	HET
SBS	Chr5	25122961	G-A	HET
SBS	Chr6	11046324	C-T	HET
SBS	Chr6	28682985	T-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g47320
SBS	Chr7	1291202	T-C	HET
SBS	Chr7	5298233	G-A	HET
SBS	Chr7	15975691	G-A	HET
SBS	Chr7	21529815	C-T	HET
SBS	Chr7	29627515	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g49460
SBS	Chr8	5931850	C-T	HET
SBS	Chr8	24948619	A-G	HET
SBS	Chr9	8985610	G-C	Homo
SBS	Chr9	14741005	C-T	HET
SBS	Chr10	3987306	A-G	HET
SBS	Chr10	8478413	C-T	HET
SBS	Chr11	18696631	C-A	HET
SBS	Chr12	13928203	G-A	HET
SBS	Chr12	13928204	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g24410

Deletions: 4

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr12	2473716	2473718	2
Deletion	Chr4	7960864	7960865	1
Deletion	Chr4	20195489	20195490	1
Deletion	Chr4	26552001	26580000	27999	6

Insertions: 10

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr12	24461894	24461895	2
Insertion	Chr6	1276190	1276195	6	LOC_Os06g03340
Insertion	Chr6	11827213	11827213	1
Insertion	Chr7	12169778	12169780	3
Insertion	Chr8	1158721	1158733	13
Insertion	Chr8	12052178	12052178	1
Insertion	Chr8	17916507	17916507	1
Insertion	Chr8	17951508	17951508	1
Insertion	Chr12	5609530	5609535	6
Insertion	Chr12	22355863	22355863	1

Inversions: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr1	3515576	3651417	LOC_Os01g07410
Inversion	Chr12	4952380	4952691
Inversion	Chr4	8052441	8804283
Inversion	Chr5	12049564	12049729
Inversion	Chr4	16012182	16012511

Translocations: 12

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr6	2186284	Chr2	12792501	LOC_Os06g04960
Translocation	Chr6	2186289	Chr2	12791391	LOC_Os06g04960
Translocation	Chr8	8179116	Chr6	12848612
Translocation	Chr4	9860844	Chr1	6870393
Translocation	Chr10	13461320	Chr4	18885956	LOC_Os10g25980
Translocation	Chr11	13528941	Chr10	6141895	LOC_Os10g11100
Translocation	Chr8	14603052	Chr1	2666555	2
Translocation	Chr10	15776586	Chr3	34340975	LOC_Os03g60380
Translocation	Chr11	19842265	Chr1	19348945
Translocation	Chr12	27080971	Chr2	12743656	LOC_Os02g21490
Translocation	Chr4	29209418	Chr2	24568877
Translocation	Chr3	30923708	Chr1	22550939

Main menu