Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 47

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	10491263	G-A	HET
SBS	Chr1	11081936	T-G	HET
SBS	Chr1	15327594	G-A	HET
SBS	Chr1	17924307	G-A	HET
SBS	Chr2	2253004	G-T	Homo
SBS	Chr2	21012866	G-A	HET
SBS	Chr2	30077003	C-T	HET
SBS	Chr3	8941166	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g16210
SBS	Chr3	12843807	C-A	HET
SBS	Chr3	15609327	G-A	HET
SBS	Chr3	15921457	C-T	HET
SBS	Chr3	15976152	A-G	HET
SBS	Chr3	16332736	C-T	HET
SBS	Chr3	18584766	A-G	HET
SBS	Chr3	22420424	T-C	HET
SBS	Chr3	27940733	G-A	HET
SBS	Chr4	1338487	C-A	HET
SBS	Chr4	21191509	G-A	HET
SBS	Chr4	22568892	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g37950
SBS	Chr4	34087049	C-T	HET
SBS	Chr5	9301111	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g16400
SBS	Chr5	14746869	T-C	HET
SBS	Chr5	19487017	A-T	HET
SBS	Chr6	2421030	C-T	Homo
SBS	Chr6	5654750	G-A	HET
SBS	Chr6	28564988	G-A	HET
SBS	Chr7	19840866	T-G	HET
SBS	Chr7	22632337	T-G	HET
SBS	Chr8	3872389	G-A	HET
SBS	Chr8	6694871	G-C	HET
SBS	Chr8	7803629	A-G	HET
SBS	Chr8	26612928	C-T	HET
SBS	Chr8	27316599	A-G	HET
SBS	Chr9	20504493	G-A	HET
SBS	Chr10	3959020	G-A	HET
SBS	Chr10	6285966	G-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g11330
SBS	Chr10	6966343	G-A	Homo
SBS	Chr10	19258197	G-T	HET
SBS	Chr11	2258590	A-C	HET
SBS	Chr11	2326337	C-T	HET
SBS	Chr11	7587452	G-A	HET
SBS	Chr11	7753063	A-T	HET
SBS	Chr11	8135402	G-T	HET
SBS	Chr11	15180057	G-A	HET
SBS	Chr12	11756978	G-A	HET
SBS	Chr12	15387881	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g26340
SBS	Chr12	16834899	G-A	HET

Deletions: 10

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	2616589	2616594	5
Deletion	Chr5	4903222	4903233	11
Deletion	Chr2	6270143	6270144	1
Deletion	Chr9	8090729	8090734	5
Deletion	Chr2	8443156	8443159	3
Deletion	Chr3	8863551	8863563	12
Deletion	Chr10	13154250	13154262	12
Deletion	Chr9	15761707	15761712	5	LOC_Os09g26144
Deletion	Chr2	20170404	20170420	16
Deletion	Chr4	20516185	20516187	2

Insertions: 9

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr10	14051554	14051555	2
Insertion	Chr12	24258687	24258688	2
Insertion	Chr1	23067221	23067224	4
Insertion	Chr2	16230649	16230649	1
Insertion	Chr5	9941976	9941976	1
Insertion	Chr6	29086294	29086294	1	LOC_Os06g48070
Insertion	Chr8	11819534	11819534	1
Insertion	Chr11	12095254	12095256	3
Insertion	Chr11	15036274	15036274	1

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr5	15482600	15833809	2
Inversion	Chr6	22483312	22521117

Translocations: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2
Translocation	Chr12	730999	Chr11	690967
Translocation	Chr11	15630258	Chr9	3034010
Translocation	Chr11	24337241	Chr2	3897894

Main menu