Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 36

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	16518329	A-T	HET
SBS	Chr1	18099322	A-T	HET
SBS	Chr1	34074151	G-C	HET
SBS	Chr1	34293775	G-A	HET
SBS	Chr1	34334656	T-C	HET
SBS	Chr1	34825676	T-A	HET
SBS	Chr1	35056118	G-A	HET
SBS	Chr2	585343	T-A	HET
SBS	Chr2	6146233	A-T	HET
SBS	Chr2	6289497	T-A	HET
SBS	Chr2	6600191	C-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g12650
SBS	Chr3	12103263	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g21200
SBS	Chr4	11966199	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g21220
SBS	Chr4	12423416	G-A	HET
SBS	Chr5	7785358	C-T	HET
SBS	Chr5	7785359	G-T	HET
SBS	Chr5	7785360	C-T	HET
SBS	Chr5	28784138	C-T	HET
SBS	Chr6	6660754	C-G	Homo
SBS	Chr6	23024629	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g38790
SBS	Chr6	23024631	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g38790
SBS	Chr6	24355280	G-C	HET
SBS	Chr6	31024915	T-C	HET
SBS	Chr7	4143646	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g08150
SBS	Chr7	9533549	C-T	HET
SBS	Chr7	20396589	G-A	HET
SBS	Chr8	1176539	C-G	HET
SBS	Chr8	18061534	C-T	HET
SBS	Chr9	137307	C-T	Homo
SBS	Chr9	12392873	A-T	HET
SBS	Chr9	20330180	T-C	HET
SBS	Chr10	527290	C-T	HET	STOP_GAINED	LOC_Os10g01800
SBS	Chr10	18163937	C-T	HET
SBS	Chr11	21167662	G-A	HET
SBS	Chr12	2048704	G-A	Homo
SBS	Chr12	4602922	G-T	HET

Deletions: 17

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr12	855933	855935	2
Deletion	Chr5	2274830	2274831	1
Deletion	Chr8	3072026	3072030	4
Deletion	Chr4	6137130	6137132	2
Deletion	Chr9	10594766	10594768	2
Deletion	Chr8	13638350	13638353	3	LOC_Os08g22670
Deletion	Chr10	16100001	16182000	81999	11
Deletion	Chr8	16860907	16860923	16
Deletion	Chr4	17592734	17592735	1
Deletion	Chr4	18541965	18541974	9	LOC_Os04g31020
Deletion	Chr4	19315924	19315926	2
Deletion	Chr10	20488000	20488006	6
Deletion	Chr12	21241321	21241324	3
Deletion	Chr4	23039113	23039127	14
Deletion	Chr1	29562001	29574000	11999	3
Deletion	Chr3	36145084	36145085	1
Deletion	Chr1	40436294	40436307	13

Insertions: 7

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr7	2525916	2525923	8
Insertion	Chr9	22605725	22605726	2
Insertion	Chr10	446581	446582	2
Insertion	Chr3	15138760	15138821	62	LOC_Os03g26510
Insertion	Chr3	15789344	15789345	2
Insertion	Chr6	26149637	26149657	21
Insertion	Chr12	1227018	1227018	1

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr4	1448463	2300969	2
Inversion	Chr8	22788481	23260520	LOC_Os08g36160
Inversion	Chr8	22788497	23260536	LOC_Os08g36160

Translocations: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr11	515052	Chr10	6152861	LOC_Os11g01960
Translocation	Chr8	985230	Chr1	25907714	LOC_Os08g02460
Translocation	Chr6	19659974	Chr2	7526445
Translocation	Chr11	22949769	Chr4	2767747	LOC_Os11g38670
Translocation	Chr6	30966502	Chr2	19023584	LOC_Os02g32200

Main menu