Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 42

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	11600886	C-T	HET
SBS	Chr1	12926505	C-T	HET
SBS	Chr1	14148533	C-A	HET
SBS	Chr1	22974866	T-C	Homo
SBS	Chr1	31311517	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g54420
SBS	Chr2	28341003	A-C	Homo
SBS	Chr3	876136	G-C	HET
SBS	Chr3	1765746	C-G	HET
SBS	Chr3	19337962	T-A	HET
SBS	Chr3	31336862	A-G	HET
SBS	Chr3	33601997	T-A	Homo
SBS	Chr3	34304511	G-T	HET
SBS	Chr4	8979387	C-G	HET
SBS	Chr4	16873381	C-T	Homo
SBS	Chr4	33362105	C-T	HET
SBS	Chr4	33550402	T-C	HET
SBS	Chr5	735749	G-A	HET
SBS	Chr5	735750	G-A	HET
SBS	Chr5	1234612	A-G	Homo
SBS	Chr5	3268958	C-T	HET
SBS	Chr6	2335636	C-A	HET
SBS	Chr6	5599740	G-A	Homo
SBS	Chr6	21934141	C-T	HET
SBS	Chr6	24042494	T-A	HET
SBS	Chr6	30888309	C-T	HET
SBS	Chr7	11374772	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g19200
SBS	Chr7	22364122	C-A	HET
SBS	Chr7	22510362	C-G	Homo
SBS	Chr8	1366398	G-A	HET
SBS	Chr8	2077758	T-C	HET
SBS	Chr8	4279491	A-T	HET
SBS	Chr8	20030597	T-C	HET
SBS	Chr8	27740300	T-C	HET
SBS	Chr9	6881049	C-T	HET
SBS	Chr10	13962175	A-G	HET
SBS	Chr11	16064622	G-C	HET
SBS	Chr11	21099590	G-T	HET
SBS	Chr12	9017047	G-A	HET
SBS	Chr12	10646838	C-A	HET
SBS	Chr12	13633965	G-A	HET
SBS	Chr12	13832562	T-C	HET
SBS	Chr12	17858716	G-A	HET

Deletions: 12

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr6	1485077	1485078	1
Deletion	Chr1	6872001	6885000	12999	2
Deletion	Chr4	9067019	9067025	6
Deletion	Chr3	11254806	11254807	1
Deletion	Chr4	11604692	11604704	12
Deletion	Chr6	13654926	13654938	12
Deletion	Chr4	13775460	13775469	9
Deletion	Chr7	17683546	17683557	11
Deletion	Chr1	25046557	25046568	11
Deletion	Chr7	25444785	25444791	6
Deletion	Chr2	26184475	26184482	7	LOC_Os02g43390
Deletion	Chr12	27301489	27301501	12	LOC_Os12g44010

Insertions: 11

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr3	16167291	16167293	3
Insertion	Chr3	34577546	34577547	2
Insertion	Chr8	26035297	26035299	3
Insertion	Chr11	27369223	27369224	2
Insertion	Chr12	3373573	3373574	2
Insertion	Chr1	2675515	2675842	328
Insertion	Chr1	18323242	18323243	2	LOC_Os01g33260
Insertion	Chr2	26840177	26840177	1
Insertion	Chr3	24130566	24130575	10
Insertion	Chr4	14637268	14637271	4
Insertion	Chr8	28426545	28426546	2

Inversions: 6

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr10	11952859	11999646
Inversion	Chr10	11952867	11999648
Inversion	Chr1	13769078	14514920	2
Inversion	Chr1	13769090	14514929	2
Inversion	Chr1	35709179	35959006
Inversion	Chr1	35851624	35959006	LOC_Os01g61930

Translocations: 11

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr8	2077294	Chr6	30888016	2
Translocation	Chr8	2077296	Chr6	30887526	2
Translocation	Chr9	7165257	Chr1	6865687
Translocation	Chr7	8303432	Chr5	14982793	2
Translocation	Chr6	10174327	Chr5	29777275
Translocation	Chr12	20096547	Chr6	23394909
Translocation	Chr12	20153354	Chr11	14826897	2
Translocation	Chr12	24160403	Chr3	8413587	LOC_Os03g15380
Translocation	Chr4	25205776	Chr3	16530906
Translocation	Chr5	29707384	Chr2	18203646	2
Translocation	Chr4	31648192	Chr3	31453198	LOC_Os04g53130

Main menu