Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 39

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	8354037	T-A	HET
SBS	Chr1	13848205	C-A	HET
SBS	Chr1	14714296	C-T	HET
SBS	Chr1	17187491	T-C	Homo
SBS	Chr1	22694162	A-G	Homo
SBS	Chr1	27713189	C-T	HET
SBS	Chr1	34768786	T-A	HET
SBS	Chr2	8841815	T-A	HET
SBS	Chr2	17875107	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g30100
SBS	Chr3	10541413	G-A	HET
SBS	Chr3	14955497	C-T	Homo
SBS	Chr3	23607570	C-T	HET
SBS	Chr3	34355514	G-A	HET
SBS	Chr3	36137404	G-A	HET
SBS	Chr4	710081	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g02140
SBS	Chr4	5927419	T-A	HET
SBS	Chr4	7420905	C-T	HET
SBS	Chr4	10580130	G-A	HET
SBS	Chr4	22642831	C-T	HET
SBS	Chr5	5428271	C-T	Homo
SBS	Chr5	16550811	C-T	HET
SBS	Chr6	485552	A-T	HET
SBS	Chr6	4482941	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g08900
SBS	Chr6	20550054	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g35220
SBS	Chr7	9391883	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g16120
SBS	Chr7	13539912	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g23944
SBS	Chr7	20108563	A-G	HET
SBS	Chr7	26240509	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g43870
SBS	Chr7	27291811	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g45710
SBS	Chr8	10956165	C-A	HET
SBS	Chr8	11816749	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g19740
SBS	Chr8	20243895	C-T	HET
SBS	Chr9	3068062	G-T	HET
SBS	Chr9	12410230	C-T	HET
SBS	Chr10	9447584	G-A	HET
SBS	Chr10	15662966	G-A	HET
SBS	Chr11	10921694	A-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g19140
SBS	Chr12	3332370	C-G	Homo
SBS	Chr12	26806715	A-G	HET

Deletions: 16

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	2512757	2512766	9
Deletion	Chr3	3603302	3603309	7
Deletion	Chr4	4030235	4030236	1	LOC_Os04g07580
Deletion	Chr9	8622574	8622584	10
Deletion	Chr3	9603255	9603262	7	LOC_Os03g17230
Deletion	Chr7	12176243	12176244	1
Deletion	Chr5	14360313	14360315	2
Deletion	Chr9	14677516	14677518	2
Deletion	Chr5	15196976	15196979	3
Deletion	Chr11	15717013	15717024	11
Deletion	Chr3	17786533	17786539	6
Deletion	Chr2	20101986	20101987	1
Deletion	Chr12	20271508	20271510	2	LOC_Os12g33560
Deletion	Chr12	23672001	23688000	15999	3
Deletion	Chr1	34731447	34731451	4
Deletion	Chr1	39594001	39607000	12999	LOC_Os01g68120

Insertions: 5

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr7	22052901	22052904	4
Insertion	Chr11	16707173	16707173	1
Insertion	Chr3	8317499	8317499	1
Insertion	Chr4	480831	480834	4
Insertion	Chr10	8093893	8093986	94

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr5	8986878	9744215	LOC_Os05g15930
Inversion	Chr5	8986891	9744216	LOC_Os05g15930

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2
Translocation	Chr9	1493711	Chr6	8906054
Translocation	Chr3	19118837	Chr1	17033381
Translocation	Chr11	22922296	Chr6	1553227
Translocation	Chr11	23286594	Chr1	41587084

Main menu