Search Nipponbare

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 50

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	20506128	C-T	HET
SBS	Chr1	24489998	G-A	HET
SBS	Chr1	36562249	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g63090
SBS	Chr1	36695200	G-T	HET
SBS	Chr1	38631803	G-A	HET
SBS	Chr10	15103539	T-A	HET
SBS	Chr10	16641526	A-G	HET
SBS	Chr10	16773683	C-T	HET
SBS	Chr10	227294	G-A	HET
SBS	Chr11	17793593	A-C	HET
SBS	Chr11	24648923	A-G	Homo
SBS	Chr11	7589979	C-G	HET
SBS	Chr12	1375929	C-T	HET
SBS	Chr12	17057241	C-T	HET
SBS	Chr12	17793899	G-A	HET
SBS	Chr12	21475791	T-G	HET
SBS	Chr12	7482786	G-A	HET
SBS	Chr12	8434952	T-C	HET
SBS	Chr2	16720148	G-A	HET
SBS	Chr2	17798782	C-T	HET
SBS	Chr2	294985	A-T	Homo
SBS	Chr2	32999160	A-C	HET
SBS	Chr2	5965931	C-T	HET
SBS	Chr2	8017356	G-A	HET
SBS	Chr3	11782205	G-C	HET
SBS	Chr3	16430760	T-C	HET
SBS	Chr4	12489794	C-T	HET
SBS	Chr4	15491741	G-A	HET
SBS	Chr4	25720165	G-T	HET
SBS	Chr4	34520290	T-A	Homo
SBS	Chr4	9483807	T-C	HET
SBS	Chr5	17749882	T-A	HET
SBS	Chr6	15903697	T-C	Homo
SBS	Chr6	17902185	G-A	HET
SBS	Chr6	22007714	C-A	HET
SBS	Chr7	15693820	A-G	HET
SBS	Chr7	15694786	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g27080
SBS	Chr7	17065022	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g29140
SBS	Chr7	26333348	T-C	HET
SBS	Chr7	5490354	C-T	Homo
SBS	Chr8	13162145	A-T	HET
SBS	Chr8	17032819	T-C	HET
SBS	Chr8	18606162	G-A	HET
SBS	Chr8	21294800	T-A	HET
SBS	Chr8	22309112	C-T	HET
SBS	Chr8	5036482	C-A	HET
SBS	Chr8	9008589	C-T	HET
SBS	Chr9	18651616	G-A	HET
SBS	Chr9	2485929	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g04660
SBS	Chr9	4495479	T-A	HET

Deletions: 15

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	662293	662295	2
Deletion	Chr5	4380150	4380152	2
Deletion	Chr11	4407213	4407216	3
Deletion	Chr4	4723848	4723855	7
Deletion	Chr3	9615539	9615545	6
Deletion	Chr6	11668089	11668091	2
Deletion	Chr1	13252001	13267000	14999	2
Deletion	Chr9	14199624	14199633	9
Deletion	Chr2	14239764	14239766	2
Deletion	Chr6	14794499	14794500	1
Deletion	Chr12	14961329	14961348	19
Deletion	Chr10	16808645	16808646	1	LOC_Os10g31990
Deletion	Chr8	23088125	23088133	8
Deletion	Chr2	32225960	32225962	2
Deletion	Chr1	34128643	34128645	2

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr10	6884165	6884166	2
Insertion	Chr9	21027694	21027695	2
Insertion	Chr9	7314134	7314135	2

Inversions: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr7	7676399	8306180	2

Translocations: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr9	15900307	Chr6	25107112
Translocation	Chr11	17270060	Chr5	20336850	LOC_Os05g34330

Main menu