Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 45

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	1999116	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g04490
SBS	Chr1	19324826	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g34940
SBS	Chr1	37552388	A-G	Homo
SBS	Chr1	40928138	C-A	HET
SBS	Chr2	2749712	C-A	Homo
SBS	Chr2	12122360	T-C	HET
SBS	Chr2	12161519	G-T	Homo
SBS	Chr2	24907787	C-T	HET
SBS	Chr2	27168502	C-T	Homo
SBS	Chr2	27168503	C-T	Homo
SBS	Chr2	34920268	A-G	HET
SBS	Chr3	7120869	A-C	Homo
SBS	Chr3	13559330	C-T	HET
SBS	Chr3	32517060	C-T	HET
SBS	Chr4	3002231	G-C	Homo
SBS	Chr4	3211450	G-A	HET
SBS	Chr4	6726260	C-A	HET
SBS	Chr4	8934072	G-A	Homo
SBS	Chr4	10578278	G-T	Homo
SBS	Chr4	14201572	G-A	HET
SBS	Chr4	14258964	G-A	HET
SBS	Chr4	16108540	A-G	HET
SBS	Chr4	34583748	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g58060
SBS	Chr5	26062622	A-T	HET
SBS	Chr5	29158565	G-A	HET
SBS	Chr6	21628597	G-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g36730
SBS	Chr6	28262940	C-T	HET
SBS	Chr7	5167908	G-A	HET
SBS	Chr7	5291115	T-A	HET
SBS	Chr7	20923497	C-T	Homo
SBS	Chr7	20978263	G-C	HET
SBS	Chr7	29201920	G-A	HET
SBS	Chr8	6858031	G-A	HET
SBS	Chr8	18619186	C-T	HET
SBS	Chr8	27435383	T-G	Homo
SBS	Chr9	6571060	C-T	Homo
SBS	Chr9	7369616	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g12810
SBS	Chr10	6522790	C-G	Homo
SBS	Chr10	13590170	C-T	HET
SBS	Chr10	19782516	G-A	Homo
SBS	Chr10	20074557	A-T	Homo
SBS	Chr11	12774886	C-T	HET
SBS	Chr11	23154236	A-G	HET
SBS	Chr12	9658301	A-G	HET
SBS	Chr12	14178000	A-G	HET

Deletions: 12

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr9	3393956	3393965	9
Deletion	Chr12	4221522	4221525	3
Deletion	Chr10	6038621	6038622	1
Deletion	Chr7	9641591	9641619	28
Deletion	Chr9	10494499	10494500	1
Deletion	Chr11	13539167	13539169	2
Deletion	Chr9	13729529	13729531	2
Deletion	Chr1	13831646	13831650	4
Deletion	Chr10	19956565	19956566	1	LOC_Os10g37260
Deletion	Chr11	20181129	20181137	8
Deletion	Chr2	32043105	32043112	7
Deletion	Chr1	40108166	40108167	1

Insertions: 6

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr1	43134513	43134518	6
Insertion	Chr3	29712908	29712909	2
Insertion	Chr4	12451878	12451881	4
Insertion	Chr5	6362961	6362966	6
Insertion	Chr5	17611700	17611703	4	LOC_Os05g30380
Insertion	Chr12	15228442	15228455	14	LOC_Os12g26140

Inversions: 6

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr2	640347	640536	LOC_Os02g02140
Inversion	Chr6	5165641	5166035
Inversion	Chr8	15183100	16045369
Inversion	Chr7	22086237	22086736	LOC_Os07g36870
Inversion	Chr7	28365107	28729523	2
Inversion	Chr7	28729527	28923900	LOC_Os07g48100

Translocations: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr11	27843730	Chr6	22525982	2

Main menu