Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 49

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	10347880	G-A	HET
SBS	Chr1	12098997	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g21600
SBS	Chr1	13349951	G-A	HET
SBS	Chr1	32411948	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g56270
SBS	Chr1	33723307	C-A	HET
SBS	Chr2	21645094	G-C	HET
SBS	Chr2	22926596	G-A	HET
SBS	Chr2	23360635	G-A	HET
SBS	Chr2	29832751	T-G	HET
SBS	Chr3	5762561	G-C	Homo
SBS	Chr3	24883315	G-T	HET
SBS	Chr3	26327217	A-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g46530
SBS	Chr3	26620003	C-T	HET
SBS	Chr3	27458252	C-A	HET
SBS	Chr3	27458253	C-A	HET
SBS	Chr3	30513091	G-A	HET
SBS	Chr3	31461980	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g55280
SBS	Chr3	31461982	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g55280
SBS	Chr4	14237387	T-C	HET
SBS	Chr4	14442177	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g25040
SBS	Chr4	21142937	A-G	HET
SBS	Chr5	3368999	A-C	HET
SBS	Chr5	5773569	T-C	Homo
SBS	Chr5	15495404	G-A	Homo
SBS	Chr5	16711300	C-A	Homo
SBS	Chr6	1600646	A-T	Homo
SBS	Chr6	1663632	T-A	Homo
SBS	Chr6	8615563	T-G	HET
SBS	Chr7	2036152	C-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g04580
SBS	Chr7	6591014	C-T	HET
SBS	Chr7	11520561	T-C	HET
SBS	Chr7	13294207	G-C	HET
SBS	Chr7	14388284	C-A	HET
SBS	Chr8	1733165	C-T	HET
SBS	Chr8	8678647	T-G	HET
SBS	Chr8	11678615	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g19530
SBS	Chr8	12756136	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g21380
SBS	Chr8	17041371	G-A	HET
SBS	Chr8	20352007	C-A	HET
SBS	Chr9	8168045	C-T	HET
SBS	Chr11	904957	G-A	HET
SBS	Chr11	3554869	G-A	HET
SBS	Chr11	8229727	C-T	HET
SBS	Chr11	8355559	T-G	HET
SBS	Chr11	9975111	C-T	HET
SBS	Chr11	12982601	A-G	HET
SBS	Chr11	14068315	C-G	HET
SBS	Chr12	15799499	C-A	HET
SBS	Chr12	17173220	A-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g29020

Deletions: 11

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr2	4773001	4802000	28999	7
Deletion	Chr11	6176085	6176092	7
Deletion	Chr2	7574312	7574314	2
Deletion	Chr12	9424544	9424545	1
Deletion	Chr1	14393001	14449000	55999	5
Deletion	Chr11	15112744	15112752	8
Deletion	Chr8	23343789	23343792	3
Deletion	Chr4	23437188	23437189	1
Deletion	Chr7	23534838	23534856	18
Deletion	Chr4	23857248	23857251	3
Deletion	Chr2	33006996	33006998	2

Insertions: 5

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr1	18185617	18185618	2
Insertion	Chr3	16422149	16422149	1
Insertion	Chr1	1825758	1825758	1
Insertion	Chr6	8811236	8811321	86	LOC_Os06g15540
Insertion	Chr12	26562552	26562553	2

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr2	4772909	4879820
Inversion	Chr2	4800619	5357101	LOC_Os02g09330
Inversion	Chr1	29511863	30086660	LOC_Os01g52370

Translocations: 14

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr2	4477116	Chr1	30086655	LOC_Os01g52370
Translocation	Chr2	4478272	Chr1	29511870
Translocation	Chr8	4909188	Chr2	17732049	LOC_Os08g08520
Translocation	Chr5	5212055	Chr1	26217213	2
Translocation	Chr4	6255416	Chr2	4788077	LOC_Os02g09300
Translocation	Chr4	6255501	Chr2	4791212
Translocation	Chr8	10395237	Chr1	31269133
Translocation	Chr9	19310216	Chr3	8414210	LOC_Os03g15380
Translocation	Chr11	22546066	Chr2	19802224
Translocation	Chr6	23516057	Chr1	19483726	LOC_Os01g35200
Translocation	Chr7	24843741	Chr6	29094877
Translocation	Chr11	26002459	Chr6	20608561
Translocation	Chr12	27198889	Chr2	4810235	LOC_Os02g09359
Translocation	Chr12	27200209	Chr2	5357008

Main menu