Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 37

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	37935022	G-A	HET
SBS	Chr2	10905833	G-C	Homo
SBS	Chr2	13145295	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g22090
SBS	Chr2	34745276	G-A	Homo
SBS	Chr3	8972161	A-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g16280
SBS	Chr3	10075822	T-C	Homo
SBS	Chr3	21988965	C-A	HET
SBS	Chr3	27833442	T-A	Homo
SBS	Chr3	29267501	C-T	HET
SBS	Chr3	30567652	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g53280
SBS	Chr3	31341845	T-C	HET
SBS	Chr4	12080867	A-T	Homo
SBS	Chr4	15152519	A-T	HET
SBS	Chr4	23789074	A-T	Homo
SBS	Chr4	28461033	G-A	Homo
SBS	Chr5	29340451	G-A	HET
SBS	Chr6	898821	G-A	HET
SBS	Chr6	14075131	A-G	HET
SBS	Chr6	20812780	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g35660
SBS	Chr7	4546827	T-C	HET
SBS	Chr7	7844806	C-T	Homo
SBS	Chr8	10676280	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g17420
SBS	Chr8	12619686	G-A	HET
SBS	Chr8	20961470	T-A	HET
SBS	Chr8	22763808	T-G	Homo
SBS	Chr9	3622656	T-G	HET
SBS	Chr9	4243426	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g08180
SBS	Chr9	4870904	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g09110
SBS	Chr9	18439743	T-G	HET
SBS	Chr10	811150	C-T	HET
SBS	Chr10	19776045	T-C	Homo
SBS	Chr11	5847093	C-T	HET
SBS	Chr11	13033649	C-T	HET
SBS	Chr12	722962	C-T	HET
SBS	Chr12	5557247	A-G	HET
SBS	Chr12	9590711	C-T	HET
SBS	Chr12	15613360	A-G	Homo

Deletions: 11

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr11	488238	488246	8
Deletion	Chr12	973635	973645	10
Deletion	Chr6	1368022	1368029	7
Deletion	Chr1	2642044	2642051	7
Deletion	Chr8	6526571	6526575	4
Deletion	Chr4	11045917	11045933	16
Deletion	Chr2	11806001	11821000	14999	2
Deletion	Chr2	11827001	11846000	18999	4
Deletion	Chr9	13081861	13081880	19
Deletion	Chr11	17380530	17380531	1
Deletion	Chr12	20827807	20827829	22

Insertions: 4

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr5	10837772	10837773	2
Insertion	Chr6	27094509	27094510	2
Insertion	Chr2	6393962	6393979	18
Insertion	Chr4	13544345	13544345	1

No Inversion

Translocations: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr4	4256200	Chr2	18649007
Translocation	Chr8	16611427	Chr1	14561805	LOC_Os08g27190

Main menu